225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3331 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2484  extracellular solute-binding protein  55.34 
 
 		 269 aa  284  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  34.94 
 
 		 276 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  35.89 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  35.54 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.6 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  31.97 
 
 		 273 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  30.45 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  34.1 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.23 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  31.87 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  33.06 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  30.58 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  30.77 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  32.46 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  32.28 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.82 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  33.46 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  29.88 
 
 		 287 aa  99.4  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  27.99 
 
 		 284 aa  98.6  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0139  hypothetical protein  30.12 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  29.03 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  30.68 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  30.54 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2676  hypothetical protein  31.17 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.829729 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  31.67 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  32.22 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  27.94 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  32.85 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  30.17 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.32 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  29.41 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  30.31 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  30.16 
 
 		 286 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  29.43 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  27.88 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  28.72 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  29.15 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  29.21 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  29.76 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.69 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  32.32 
 
 		 306 aa  89.4  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0781  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 281 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  28.52 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  29.41 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.27 
 
 		 300 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  29.5 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  28.46 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  27.85 
 
 		 299 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.85 
 
 		 299 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.85 
 
 		 299 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.85 
 
 		 299 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.85 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.85 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.85 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.47 
 
 		 278 aa  85.5  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  29.44 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  28.27 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  28.63 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  27.37 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  29.53 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.1 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  29.72 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  28.41 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  32.38 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  29.59 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.51 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  29.21 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  26.84 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  34.55 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.44 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  35.15 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0052  extracellular solute-binding protein  33.55 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  26.98 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  27.38 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  35.46 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  32.31 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  27.42 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  35.25 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  27.11 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  26 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  26.21 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.64 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  31.51 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  29.53 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  27.78 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  27.67 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  25.62 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  29.2 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  30.16 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1882  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.51 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.628761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  30.35 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  33.65 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  27.68 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0660  extracellular solute-binding protein, family 1  26.2 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5102800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  25.51 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>