198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2676 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2676  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  510  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.829729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0139  hypothetical protein  80.97 
 
 		 265 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  54.42 
 
 		 269 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  29.32 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  31.09 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  29.48 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  36.19 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.31 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2484  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  29.58 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.77 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  27.24 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  28.62 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  31.68 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.22 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.73 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  29.57 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  30.52 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  26.47 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  27.57 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  27.59 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  26.51 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  27 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  28.76 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  27.8 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0647  extracellular solute-binding protein, family 1  27.34 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000964521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0661  extracellular solute-binding protein, family 1  27.78 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.81727e-24 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  30.18 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  29.33 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  27.75 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3493  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  26.27 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0660  extracellular solute-binding protein, family 1  27.84 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5102800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0052  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  33.08 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  25 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3795  putative periplasmic phosphate-binding protein  27.78 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0718968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3729  putative periplasmic phosphate-binding protein  27.78 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  29.02 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  24.4 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  26.79 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3836  putative periplasmic phosphate-binding protein  27.35 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  27.15 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  24.18 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  27.98 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  24.32 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.32 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.32 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.32 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.32 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.32 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  23.08 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3898  putative periplasmic phosphate-binding protein  27.35 
 
 		 498 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  0.815113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.32 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  29.09 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.58 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.79 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  25.58 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  25.6 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  28.17 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  27.36 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  26.94 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  35.92 
 
 		 381 aa  65.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  27.03 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  28.29 
 
 		 1035 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  26.11 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1967  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  25.67 
 
 		 862 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543569  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.17 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  25.63 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  26.89 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3906  hypothetical protein  24.87 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  26 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  25 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  25.37 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  29.55 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  27.86 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  28.99 
 
 		 903 aa  62.4  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  27.6 
 
 		 435 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24.26 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  26.76 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  28.1 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  26.46 
 
 		 498 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0781  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  25.56 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  30.77 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1735  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  26.3 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1794  phosphate-binding protein PstS-like protein  23.17 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  29 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  24.19 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.76 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3709  hypothetical protein  24.87 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.447391 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.21 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  22.54 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  39.77 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  25.79 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  27.06 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  25.36 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>