229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2771 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0781  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0052  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 276 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  29.29 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0660  extracellular solute-binding protein, family 1  28.28 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5102800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  26.69 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  32.28 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0647  extracellular solute-binding protein, family 1  28.02 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000964521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3493  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0661  extracellular solute-binding protein, family 1  25.37 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.81727e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0648  extracellular solute-binding protein, family 1  23.6 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117296  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2676  hypothetical protein  29.32 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.829729 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  26.55 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  25.57 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0139  hypothetical protein  28.11 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  28 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  26.28 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2484  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  28.92 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  28.52 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  25.7 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  28.62 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.69 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  25.87 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.83 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.28 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  27.94 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  26.24 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1735  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  25.94 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  23 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  27.2 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.44 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  26.05 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  26.95 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  25.52 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  23.92 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.71 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  26.38 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  30.04 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  28.73 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  26.35 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.46 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  28.79 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  25.18 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  27.17 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  25.98 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  25.27 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0005  extracellular solute-binding protein, family 1  25.35 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  22.73 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  26.69 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  24.91 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  24.28 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13780  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.56 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0228402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  27.34 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  26.61 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  29.13 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  24.2 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  26.82 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  24.51 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.23 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  27.82 
 
 		 558 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  24.06 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  23.17 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  25.19 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  27.39 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.56 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  27.34 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2567  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  32.41 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  25.79 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  25.51 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1379  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  32.67 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000788807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  23.98 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  25.54 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  25.71 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.05 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  26.32 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.42 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  24.45 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  24.03 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  23.08 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  25.64 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  25.68 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  25.79 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  24.07 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  25.68 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.22 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  22.58 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.32 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  27.3 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  26.62 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03232  hypothetical protein  24.19 
 
 		 501 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  25.49 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  24.81 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  22.85 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  22.85 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6248  putative phosphate binding ABC transporter  26.76 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0983725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  26.33 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  26.74 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>