180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3493 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3493  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0781  extracellular solute-binding protein  58.12 
 
 		 281 aa  322  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0648  extracellular solute-binding protein, family 1  38.62 
 
 		 275 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0052  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0661  extracellular solute-binding protein, family 1  38.71 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.81727e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0647  extracellular solute-binding protein, family 1  40.49 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000964521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0660  extracellular solute-binding protein, family 1  40.56 
 
 		 276 aa  191  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5102800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  34.47 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1735  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  29.2 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  27.8 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  28.4 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  25.19 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  28.89 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  25.89 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  26.55 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2484  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152963  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  23.05 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  27.14 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.9 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  25.27 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  25.93 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  26.74 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2676  hypothetical protein  26 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.829729 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  23.98 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  22.81 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  22.83 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  24.91 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  27.13 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  25.57 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  25.83 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3625  hypothetical protein  21.9 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03279  hypothetical protein  21.9 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4737  hypothetical protein  21.9 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03231  hypothetical protein  21.9 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0286  hypothetical protein  21.9 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0139  hypothetical protein  24.79 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  23.74 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  23.72 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  23.02 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  24.23 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  22.64 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  24.21 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3708  hypothetical protein  23.76 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371578 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  21.77 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  24.63 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  25.31 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  22.22 
 
 		 498 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  24.54 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  24.11 
 
 		 1035 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  21.37 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  25 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1379  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  33.33 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000788807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.37 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  25.84 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  22.64 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  23.21 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0005  extracellular solute-binding protein, family 1  24.07 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13780  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  23.69 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0228402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  23.42 
 
 		 669 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0311  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  26.83 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  23.05 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  26.59 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  23.48 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  25.69 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  26.12 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  25.29 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.57 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  24.34 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  23.72 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  23.53 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  30.36 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3836  putative periplasmic phosphate-binding protein  23.47 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  23.31 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  22.73 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1794  phosphate-binding protein PstS-like protein  21.37 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3795  putative periplasmic phosphate-binding protein  23.27 
 
 		 486 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0718968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  29.91 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  29.91 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.22 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  22.9 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  24.71 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3729  putative periplasmic phosphate-binding protein  23.27 
 
 		 486 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  22.26 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  20.45 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3898  putative periplasmic phosphate-binding protein  23.27 
 
 		 498 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  0.815113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  21.72 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  21.43 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  22.71 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  22.39 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  23.9 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  23.04 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1966  hemolysin precursor, putative  27.36 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  20.78 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  24.46 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  24.88 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  27.06 
 
 		 328 aa  52.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6248  putative phosphate binding ABC transporter  21.22 
 
 		 510 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0983725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  25.55 
 
 		 482 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>