290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1146 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  100 
 
 
279 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  33.06 
 
 
272 aa  148  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  33.89 
 
 
381 aa  132  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  32.07 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.72 
 
 
299 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  29.71 
 
 
278 aa  126  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  31.47 
 
 
279 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  31.33 
 
 
274 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  35.71 
 
 
284 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  31.45 
 
 
284 aa  122  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  31.58 
 
 
274 aa  119  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  30.61 
 
 
276 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  28.38 
 
 
284 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.61 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  27.82 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  28.22 
 
 
290 aa  116  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  31.01 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  29.6 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  30.77 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  29.52 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.76 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.61 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  31.42 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  31.42 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  27.14 
 
 
273 aa  113  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  29.78 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  31.42 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  30 
 
 
279 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.63 
 
 
278 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  29.83 
 
 
292 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  25.94 
 
 
273 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.51 
 
 
291 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  26.88 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  27.85 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  24.65 
 
 
558 aa  108  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.05 
 
 
269 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  26.56 
 
 
272 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  30.86 
 
 
281 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  32.24 
 
 
281 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
273 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  29.84 
 
 
303 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  29.44 
 
 
272 aa  105  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.26 
 
 
302 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.61 
 
 
277 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  26.61 
 
 
267 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  27 
 
 
290 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  28.1 
 
 
277 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  26.99 
 
 
585 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.62 
 
 
298 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  26.77 
 
 
288 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  27.71 
 
 
274 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  28.76 
 
 
285 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.82 
 
 
278 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  29.13 
 
 
272 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  27.96 
 
 
272 aa  102  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  25.7 
 
 
274 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  26.4 
 
 
290 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  29.66 
 
 
287 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.04 
 
 
288 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  29.39 
 
 
272 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
268 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.27 
 
 
218 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  30.33 
 
 
281 aa  99  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  26.42 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  25.81 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  28.39 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  30.94 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  28.71 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.5 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  27.72 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  31.02 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  27.16 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  24.46 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28.05 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  25.4 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  30.57 
 
 
519 aa  93.2  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  28.63 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  26.1 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  26.09 
 
 
271 aa  92  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  25.32 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.06 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  25.32 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  28.57 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  25.68 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  29.03 
 
 
328 aa  89.7  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1882  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.54 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.628761  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  24.57 
 
 
261 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  27.34 
 
 
278 aa  89  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  27.09 
 
 
416 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  26.97 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.41 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  26.2 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.33 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.33 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.33 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  26.02 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25 
 
 
299 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  25 
 
 
299 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  26.64 
 
 
428 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25 
 
 
299 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>