More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0417 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 585 aa  1185    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  30.79 
 
 		 519 aa  207  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  29.81 
 
 		 562 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 		 734 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  30.54 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  26.79 
 
 		 464 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  28.76 
 
 		 451 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  26.68 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  26.16 
 
 		 465 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  29.12 
 
 		 558 aa  170  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  27.53 
 
 		 435 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  26.37 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  28.06 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  28.05 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  26.88 
 
 		 435 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  26.51 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  26.94 
 
 		 435 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  28.03 
 
 		 517 aa  151  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  27.89 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  31.08 
 
 		 270 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  24.27 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.99 
 
 		 279 aa  103  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  27.93 
 
 		 272 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  27.93 
 
 		 272 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  27.93 
 
 		 272 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  27.51 
 
 		 512 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  26.64 
 
 		 285 aa  97.8  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  28.15 
 
 		 281 aa  97.4  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  28.66 
 
 		 558 aa  97.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  26.13 
 
 		 303 aa  94.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  29.41 
 
 		 287 aa  94  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  26.46 
 
 		 272 aa  93.2  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.43 
 
 		 278 aa  92  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  28.02 
 
 		 281 aa  90.9  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  25.86 
 
 		 284 aa  90.9  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  25.23 
 
 		 273 aa  90.9  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  30.05 
 
 		 332 aa  89.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  26.45 
 
 		 281 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  30.99 
 
 		 281 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.98 
 
 		 285 aa  88.6  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3522  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  32.45 
 
 		 276 aa  88.6  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  29.29 
 
 		 264 aa  87.8  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  25.7 
 
 		 268 aa  87  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  26.58 
 
 		 278 aa  86.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  26.58 
 
 		 279 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  29.02 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  25.09 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  28.91 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  25.33 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 273 aa  83.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  28.82 
 
 		 280 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  29.44 
 
 		 302 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  24.35 
 
 		 273 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  26.41 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  31.35 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  26.91 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  28.22 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  29.25 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  23.01 
 
 		 279 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  27.93 
 
 		 284 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  25.68 
 
 		 267 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  27.85 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.97 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  27.33 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  22.87 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  28.82 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  28.57 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  30 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  28.32 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  26.32 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  25 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.55 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  27.73 
 
 		 323 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.96 
 
 		 285 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  26.87 
 
 		 263 aa  77  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  27.31 
 
 		 323 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  26.18 
 
 		 269 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  26.16 
 
 		 323 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.8 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0005  extracellular solute-binding protein, family 1  28.45 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  27.43 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  26.36 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  27.31 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  27.31 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  25.44 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  27.89 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.96 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  24.78 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  24.11 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  26.89 
 
 		 323 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  26.89 
 
 		 323 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  28.99 
 
 		 255 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 290 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  26.89 
 
 		 323 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  26.89 
 
 		 323 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  27.27 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  24.58 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  26.05 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  25.9 
 
 		 332 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>