More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2475 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  85.91 
 
 		 451 aa  779    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  100 
 
 		 447 aa  898    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  67.76 
 
 		 444 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  63.53 
 
 		 460 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  59.86 
 
 		 428 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  60.71 
 
 		 464 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  58.88 
 
 		 465 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  56.66 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  55.69 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  56.17 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  55.69 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  47.46 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  46.65 
 
 		 558 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  40.81 
 
 		 562 aa  340  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  44.34 
 
 		 734 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  40.05 
 
 		 519 aa  292  9e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  30.54 
 
 		 585 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  30.59 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  35.46 
 
 		 268 aa  143  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  24.77 
 
 		 517 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  37.05 
 
 		 270 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  35.09 
 
 		 276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  28.14 
 
 		 499 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  33.19 
 
 		 272 aa  123  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  33.77 
 
 		 284 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  33.92 
 
 		 270 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  33.2 
 
 		 284 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  33.04 
 
 		 281 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  32.59 
 
 		 281 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  34.21 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  31.62 
 
 		 281 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  31.42 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  33.19 
 
 		 272 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  36.02 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  33.92 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  35.38 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  32.94 
 
 		 283 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  33.67 
 
 		 558 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  31.28 
 
 		 290 aa  110  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  31.86 
 
 		 272 aa  110  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  29.65 
 
 		 273 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  33.04 
 
 		 272 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  33.04 
 
 		 272 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  33.04 
 
 		 272 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  30.22 
 
 		 285 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  32.61 
 
 		 303 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  33.92 
 
 		 278 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  30.97 
 
 		 271 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  31.42 
 
 		 287 aa  104  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  34.01 
 
 		 267 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  30.4 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  35.53 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  31.28 
 
 		 272 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  31.19 
 
 		 302 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  35.26 
 
 		 280 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  32.19 
 
 		 274 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  32.13 
 
 		 302 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  30.53 
 
 		 290 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  32.02 
 
 		 281 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  100  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  25.47 
 
 		 512 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  31.14 
 
 		 277 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  31.25 
 
 		 279 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.04 
 
 		 299 aa  98.2  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28.26 
 
 		 218 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  30.17 
 
 		 273 aa  97.1  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  31.91 
 
 		 330 aa  97.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.32 
 
 		 277 aa  96.7  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.7 
 
 		 272 aa  96.3  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  33.2 
 
 		 285 aa  96.3  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  32.56 
 
 		 282 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  32.23 
 
 		 323 aa  96.3  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  30.53 
 
 		 279 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  31.95 
 
 		 323 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  36 
 
 		 278 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  31.78 
 
 		 274 aa  94.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  29.91 
 
 		 274 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  31.31 
 
 		 292 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  31.95 
 
 		 323 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  31.95 
 
 		 323 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  31.95 
 
 		 323 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  31.54 
 
 		 323 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  31.95 
 
 		 323 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  31.54 
 
 		 323 aa  94  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  31.17 
 
 		 273 aa  93.6  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.33 
 
 		 278 aa  93.6  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.48 
 
 		 285 aa  93.6  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  29.18 
 
 		 273 aa  93.2  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  31.12 
 
 		 323 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  31.43 
 
 		 284 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  31.12 
 
 		 323 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  31.95 
 
 		 323 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  30.51 
 
 		 274 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  27.38 
 
 		 512 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  29.91 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  30.71 
 
 		 323 aa  91.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  31.28 
 
 		 281 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  28.76 
 
 		 269 aa  91.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>