More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2919 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  100 
 
 		 517 aa  1040    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  46.14 
 
 		 513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  41.5 
 
 		 512 aa  349  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  39.33 
 
 		 499 aa  340  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  40.49 
 
 		 512 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3568  hypothetical protein  31.8 
 
 		 508 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  31.32 
 
 		 558 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  30.73 
 
 		 464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  29.32 
 
 		 519 aa  172  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  30.09 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  29.32 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  29.98 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  29.55 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  25.92 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  28.03 
 
 		 585 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  26.48 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  26.48 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  27.82 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  27.79 
 
 		 562 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  24.77 
 
 		 447 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  26.91 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  25.75 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 734 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  28.44 
 
 		 272 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  28.25 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  26.7 
 
 		 270 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.5 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  23.5 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  27.72 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  26.53 
 
 		 284 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  26.44 
 
 		 272 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  27.07 
 
 		 271 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  28.31 
 
 		 281 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  27.27 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  28.71 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  26.82 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  28 
 
 		 278 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.65 
 
 		 269 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  30.77 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  26.42 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.85 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  25.86 
 
 		 280 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  27.81 
 
 		 269 aa  72  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.61 
 
 		 276 aa  72  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  26.79 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  28.16 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  23.31 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  25.93 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  25.22 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  23.46 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  23.04 
 
 		 290 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  24.28 
 
 		 284 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  27.14 
 
 		 270 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  23.5 
 
 		 276 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  27.81 
 
 		 274 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.23 
 
 		 285 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.4 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  26.01 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  27.4 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  22.32 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  24.11 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  28.89 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  29.17 
 
 		 261 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  25.7 
 
 		 273 aa  66.6  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  28.8 
 
 		 283 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  26.35 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  27.84 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  26.55 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  22.37 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.84 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  25.58 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  27.83 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  23.45 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  25.58 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  28.74 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5020  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  29.61 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0412973  normal  0.0299146 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  27.27 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  25 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  23.71 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  23.46 
 
 		 273 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  27.53 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  25.7 
 
 		 273 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  26.15 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  23.61 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  25.88 
 
 		 264 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  42.86 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.88 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  28 
 
 		 292 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0311  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  30.11 
 
 		 325 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.24 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  26.2 
 
 		 288 aa  62  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  31.48 
 
 		 286 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24.61 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24.09 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  34.91 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  26.32 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  26.63 
 
 		 278 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>