More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1170 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  100 
 
 		 512 aa  987    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  81.45 
 
 		 499 aa  777    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  96.68 
 
 		 512 aa  910    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  44.81 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  40.86 
 
 		 517 aa  359  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  32.16 
 
 		 558 aa  176  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  26.56 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  29.07 
 
 		 562 aa  141  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  30.61 
 
 		 482 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 		 585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3568  hypothetical protein  31.71 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  31.72 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  31.33 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  30.24 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  30.34 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 		 734 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  29.61 
 
 		 460 aa  127  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  32.25 
 
 		 428 aa  126  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  29.45 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  29.68 
 
 		 435 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  28.9 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  29.02 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  27.51 
 
 		 447 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  27.47 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  26.94 
 
 		 284 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  24.66 
 
 		 285 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  25.21 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.76 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  22.86 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  27.49 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  24.56 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  28.32 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  26.9 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  31.48 
 
 		 185 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  31.61 
 
 		 248 aa  63.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  27.69 
 
 		 267 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  27.62 
 
 		 270 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  25.21 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  26.9 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  25.41 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.99 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0005  extracellular solute-binding protein, family 1  24.81 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  30.41 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  35.37 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  27.27 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  19.4 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  24.88 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  26.37 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  23.2 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0023  OmpA  30.12 
 
 		 591 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  25.88 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  29.89 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  34.31 
 
 		 560 aa  60.1  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 560 aa  60.1  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  26.88 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.71 
 
 		 707 aa  60.1  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  25.96 
 
 		 299 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  33.03 
 
 		 890 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  34.86 
 
 		 352 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  36.54 
 
 		 320 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  26.18 
 
 		 302 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  29.55 
 
 		 233 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  31.74 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  33.02 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  23.18 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  35.58 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  23.6 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  29.11 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  31.62 
 
 		 631 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  25.34 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 220 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  33.33 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  40.82 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  32.97 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  40.82 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  33.86 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  33.66 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  28.19 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  40.82 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  28.09 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  30.47 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2645  OmpA/MotB  37.38 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  34.31 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  35.92 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  36.25 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.8 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  36.25 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  36.25 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>