More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1209 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 369 aa  763    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  46.45 
 
 		 422 aa  305  6e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  27.7 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  48.25 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  48.18 
 
 		 498 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 510 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 623 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  41.6 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  40.68 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 420 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  42.74 
 
 		 463 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  39.83 
 
 		 464 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  47.41 
 
 		 429 aa  96.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  37.09 
 
 		 537 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  41.03 
 
 		 364 aa  96.3  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  44.55 
 
 		 218 aa  95.9  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  39.81 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 205 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46 
 
 		 321 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.24 
 
 		 707 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 543 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.36 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  45.22 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 		 630 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.72 
 
 		 542 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  47.52 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  44.23 
 
 		 229 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 193 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 169 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  46.53 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  46.53 
 
 		 344 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  46.53 
 
 		 344 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 544 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 215 aa  90.1  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  45.54 
 
 		 344 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  47.57 
 
 		 447 aa  89.7  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  39.82 
 
 		 620 aa  89.4  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  36.84 
 
 		 478 aa  89  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  43.27 
 
 		 233 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  45.54 
 
 		 345 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  41.28 
 
 		 510 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  44.9 
 
 		 417 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  39.83 
 
 		 463 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 		 222 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 1755 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 210 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.57 
 
 		 248 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  45.54 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  40.37 
 
 		 222 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 216 aa  87  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1987 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 		 209 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.53 
 
 		 319 aa  86.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 		 209 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  37.59 
 
 		 640 aa  86.7  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  44.9 
 
 		 416 aa  86.3  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 704 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  39.82 
 
 		 694 aa  86.3  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 206 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  40.59 
 
 		 890 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  40.15 
 
 		 260 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  36.44 
 
 		 464 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 		 241 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  38.61 
 
 		 209 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  41.9 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  44.55 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  39.17 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  36.92 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  34.62 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 206 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 217 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  42.15 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 		 729 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  43 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  40 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.59 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  40.38 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  41.51 
 
 		 641 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  37.5 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  35.66 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  40.95 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.22 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  43.27 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 		 727 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  43.68 
 
 		 670 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  40.38 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  39.19 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>