More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1355 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  97.32 
 
 		 560 aa  1122    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 560 aa  1151    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 560 aa  1151    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  27.43 
 
 		 555 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  25.45 
 
 		 552 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  24.86 
 
 		 558 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  24.67 
 
 		 558 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  24.67 
 
 		 558 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  25.09 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  26.87 
 
 		 569 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  37.76 
 
 		 587 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  36.62 
 
 		 572 aa  100  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  23.14 
 
 		 550 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 575 aa  95.1  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 576 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  39.17 
 
 		 578 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  38.98 
 
 		 573 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  38.33 
 
 		 578 aa  90.5  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 		 578 aa  90.5  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  34.35 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.3 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  42.99 
 
 		 223 aa  79.3  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.56 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  38.68 
 
 		 620 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.56 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  47.44 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  39.25 
 
 		 260 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  35.85 
 
 		 310 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 263 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  48.1 
 
 		 525 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  40.91 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  40.91 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  39.25 
 
 		 260 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  41.3 
 
 		 214 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  40.91 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  37.27 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 263 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  40.91 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  40.91 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  40.91 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  37.23 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  38.2 
 
 		 1026 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  34.95 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  40.22 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 658 aa  75.1  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  36.19 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  39.77 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  48.65 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  35.83 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  35.85 
 
 		 631 aa  75.1  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  39.77 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  31.43 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  44.87 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  42.31 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  35.85 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  40.91 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  35.9 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 543 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  35.04 
 
 		 330 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  45.95 
 
 		 209 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 630 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 226 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  39.64 
 
 		 261 aa  73.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  29.75 
 
 		 374 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  33.94 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  39.05 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.84 
 
 		 224 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  35.85 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  37.35 
 
 		 533 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  46.05 
 
 		 215 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  35.85 
 
 		 641 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  45.05 
 
 		 236 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  44.59 
 
 		 209 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.19 
 
 		 542 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 459 aa  72  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  34.86 
 
 		 640 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 175 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  39.08 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>