More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7144 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  100 
 
 		 332 aa  678    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  45.51 
 
 		 331 aa  268  8e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  37.76 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  36.95 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  38.82 
 
 		 317 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  35.06 
 
 		 481 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  35.01 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35.95 
 
 		 487 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  33.77 
 
 		 497 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35.95 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  34.73 
 
 		 484 aa  170  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  35.95 
 
 		 487 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  35.01 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  34.37 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  33.75 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  32.25 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  32.13 
 
 		 481 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 485 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  30.58 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 485 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  30.92 
 
 		 479 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  33.78 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  30.59 
 
 		 485 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  36.88 
 
 		 364 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  30.59 
 
 		 485 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  30.7 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  30.59 
 
 		 485 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  31.94 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  32.11 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  31.77 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  29.65 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  31.8 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  29.39 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.18 
 
 		 407 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  45.19 
 
 		 429 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  49.5 
 
 		 321 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  42.24 
 
 		 433 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  47.06 
 
 		 277 aa  86.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 434 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 468 aa  85.9  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.24 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  43 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  40.78 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43 
 
 		 447 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  49.02 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  49.02 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  49.02 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  49.02 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  46.36 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  48.54 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  49.02 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  44.12 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  41.09 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3385  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.464249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  48.04 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  29.29 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  40.78 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  48.04 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  48.04 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  48.04 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  44.76 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  45.1 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  41.18 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  41.18 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  41.18 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  38.93 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  41.18 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  41.18 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  41.18 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  41.18 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  41.18 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  41.18 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>