More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3385 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3385  OmpA/MotB  100 
 
 		 242 aa  471  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.464249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  53.85 
 
 		 317 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  38.85 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 331 aa  98.6  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 337 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 349 aa  96.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 350 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  46.67 
 
 		 334 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  48.04 
 
 		 337 aa  92.4  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  37.5 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 326 aa  89.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  48.04 
 
 		 316 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  40.38 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  41.8 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  38.6 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  39.22 
 
 		 466 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  44.12 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 468 aa  79  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  35.09 
 
 		 466 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 		 304 aa  78.6  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  40.4 
 
 		 459 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 		 485 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  39.39 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 481 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 		 485 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  43 
 
 		 1984 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 420 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  40.78 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  37.7 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  41.48 
 
 		 486 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  40.78 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  40.78 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  39.81 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  40.78 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  40.78 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  40.78 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  40.78 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  40.78 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  39.05 
 
 		 364 aa  72.4  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  38.21 
 
 		 485 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 537 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  38.21 
 
 		 487 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 623 aa  72  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  38.21 
 
 		 487 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  44.19 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  40.78 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  48.31 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  42 
 
 		 2000 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  36 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  38.21 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 497 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  38.83 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  43.69 
 
 		 1987 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  38.84 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.64 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  37.25 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  35.85 
 
 		 694 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  32.02 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40 
 
 		 350 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  50 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  38 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  36.44 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  38.83 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40 
 
 		 350 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  37.19 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  38 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  36.44 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  39.22 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  38 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  32.02 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  33.01 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  38 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 523 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  34.31 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1228  OmpA/MotB  44.32 
 
 		 364 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>