More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1376 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  91.67 
 
 		 466 aa  876    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 468 aa  972    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  57.23 
 
 		 454 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  56.99 
 
 		 459 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  56.09 
 
 		 459 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  51.26 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  51.37 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.79 
 
 		 447 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  30.82 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  33.52 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  46.54 
 
 		 429 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.82 
 
 		 344 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  32.07 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  47.64 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  32.46 
 
 		 319 aa  150  6e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  31.82 
 
 		 344 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  31.61 
 
 		 319 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  31.64 
 
 		 345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  32.58 
 
 		 344 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  32.58 
 
 		 344 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  32.58 
 
 		 344 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  31.34 
 
 		 344 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  30.39 
 
 		 351 aa  143  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  31.56 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  31.56 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.3 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  29.64 
 
 		 381 aa  132  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  31.82 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  29.27 
 
 		 345 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  31.27 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  29.83 
 
 		 394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  32.18 
 
 		 328 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  51.38 
 
 		 210 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  46.09 
 
 		 417 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 314 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  51.38 
 
 		 443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  27.52 
 
 		 335 aa  114  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  32.2 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  30.74 
 
 		 1793 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  30.88 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  44.35 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  29.86 
 
 		 321 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  27.82 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  48.6 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  46.36 
 
 		 209 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  28.16 
 
 		 337 aa  104  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  45.69 
 
 		 375 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  26.61 
 
 		 367 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  28.2 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  28.12 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  46.79 
 
 		 223 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  27.46 
 
 		 331 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  41.59 
 
 		 209 aa  99.8  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 380 aa  100  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  27.33 
 
 		 330 aa  99.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  23.98 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 209 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  46.08 
 
 		 229 aa  98.2  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 209 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.45 
 
 		 407 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  47 
 
 		 200 aa  98.2  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  46.3 
 
 		 401 aa  97.8  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 416 aa  97.4  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  44.9 
 
 		 428 aa  97.1  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  49.02 
 
 		 412 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  41.38 
 
 		 218 aa  97.1  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  50 
 
 		 694 aa  97.1  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  45.54 
 
 		 201 aa  96.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  28.05 
 
 		 333 aa  97.1  7e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  44.44 
 
 		 352 aa  96.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  44.12 
 
 		 201 aa  96.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  29.5 
 
 		 363 aa  96.7  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  29.14 
 
 		 370 aa  96.3  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  28.71 
 
 		 342 aa  96.3  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  46 
 
 		 169 aa  96.3  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  25.5 
 
 		 318 aa  96.3  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 349 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05164  hypothetical protein  28.14 
 
 		 301 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 372 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  41.38 
 
 		 212 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  26.23 
 
 		 365 aa  95.9  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  46.08 
 
 		 640 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  47 
 
 		 201 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  43.93 
 
 		 221 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  47.52 
 
 		 422 aa  95.1  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 202 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 		 202 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  39.52 
 
 		 1984 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  40.37 
 
 		 420 aa  94.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  29.14 
 
 		 367 aa  94.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  46 
 
 		 202 aa  94  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 		 350 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  28.09 
 
 		 369 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  47.06 
 
 		 219 aa  94  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>