More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0236 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  100 
 
 		 334 aa  684    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  41.48 
 
 		 321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  41.64 
 
 		 317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  37.36 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  36.78 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  39.31 
 
 		 350 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  37.85 
 
 		 337 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  37.66 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  35.01 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  33.44 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  29.85 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  32.44 
 
 		 485 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  31.44 
 
 		 485 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  31.1 
 
 		 485 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  33.22 
 
 		 484 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  31.79 
 
 		 481 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  31.44 
 
 		 485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  37.28 
 
 		 364 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 485 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 304 aa  126  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  29.05 
 
 		 479 aa  125  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  30.67 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  30.69 
 
 		 487 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  29.18 
 
 		 487 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  30.92 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  28.01 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  28.43 
 
 		 481 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  27.61 
 
 		 481 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.7 
 
 		 407 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.99 
 
 		 537 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 459 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 459 aa  93.2  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  30.96 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  38.28 
 
 		 433 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 454 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 468 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 236 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 217 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 466 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  28.38 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 		 434 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  27.82 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  30.54 
 
 		 310 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 209 aa  89.4  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  48.51 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 457 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 417 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  42.57 
 
 		 466 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  37.98 
 
 		 270 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  41.32 
 
 		 620 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 224 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  42.15 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  43.86 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  40.32 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  44 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  40.18 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  40.78 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  45 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  43.14 
 
 		 217 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  36.11 
 
 		 269 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.14 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  40 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  29.69 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  38.89 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  40.19 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  38.68 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  41.75 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  45 
 
 		 890 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  43.17 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  41.18 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  39.81 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>