More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1240 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 434 aa  877    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  88.94 
 
 		 432 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  43.57 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 		 443 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  37.42 
 
 		 468 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  35.65 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  36.96 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  34.62 
 
 		 457 aa  253  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  35.99 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  63.18 
 
 		 333 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  63.5 
 
 		 333 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.71 
 
 		 427 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  50 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 		 359 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  46.39 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  29.09 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  28.54 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  44.27 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.2 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  42.4 
 
 		 344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40.91 
 
 		 344 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  41.6 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  42.4 
 
 		 344 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  42.4 
 
 		 344 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  42.4 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  48.25 
 
 		 209 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  44.23 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  41.73 
 
 		 314 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  42.31 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 210 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40.8 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40.8 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  25.06 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  49.02 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  42.72 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  48.04 
 
 		 537 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 		 498 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  48.04 
 
 		 296 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  34.38 
 
 		 240 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  25.17 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  36.57 
 
 		 290 aa  98.2  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 216 aa  97.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  48.57 
 
 		 337 aa  96.7  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  40.2 
 
 		 380 aa  96.7  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  27.95 
 
 		 456 aa  95.5  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  42.99 
 
 		 337 aa  96.3  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  38.28 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 		 349 aa  94.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  36 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  36 
 
 		 319 aa  94.4  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  43.43 
 
 		 233 aa  94.4  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  43.93 
 
 		 205 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 261 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  45.71 
 
 		 333 aa  93.6  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 335 aa  93.2  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  43.14 
 
 		 261 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  47.52 
 
 		 311 aa  92.8  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  43.14 
 
 		 261 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.94 
 
 		 168 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  41.58 
 
 		 224 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  39.81 
 
 		 229 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  35.33 
 
 		 319 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 		 215 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  42.62 
 
 		 364 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  48.04 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  39.09 
 
 		 260 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 		 220 aa  91.3  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 229 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 263 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 		 220 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 263 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 375 aa  90.9  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 		 220 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 		 220 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 		 220 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 		 220 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  29.82 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  45.1 
 
 		 220 aa  90.5  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  42.16 
 
 		 218 aa  89.7  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 428 aa  89.7  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 169 aa  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  39.2 
 
 		 440 aa  89.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 		 214 aa  89.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  45.1 
 
 		 219 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  45.1 
 
 		 219 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  44.76 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0591  OmpA/MotB family outer membrane protein  28.87 
 
 		 241 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 262 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  45.1 
 
 		 219 aa  89.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>