More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0632 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  989    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  60.68 
 
 		 497 aa  597  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  49.27 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  48.76 
 
 		 484 aa  478  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  46.79 
 
 		 487 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  46.17 
 
 		 487 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  45.76 
 
 		 487 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  39.96 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  40.79 
 
 		 485 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  41.32 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.04 
 
 		 481 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  36.24 
 
 		 321 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  35.06 
 
 		 332 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 317 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 		 331 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  34.68 
 
 		 333 aa  147  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  30.56 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  32.37 
 
 		 350 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  32.53 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  32.51 
 
 		 304 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  31.27 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  29.1 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  27.13 
 
 		 349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  27.61 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  28.05 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  31.17 
 
 		 319 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.98 
 
 		 407 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.19 
 
 		 321 aa  87.4  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  45.92 
 
 		 447 aa  87.4  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  47.17 
 
 		 209 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40.65 
 
 		 344 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40.65 
 
 		 344 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  37.6 
 
 		 229 aa  86.7  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 		 263 aa  86.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40.65 
 
 		 344 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.32 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40.65 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  38.24 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.4 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.09 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.71 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  28.45 
 
 		 310 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  42.42 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 210 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  35.51 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  38.6 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 623 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  40.38 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  40.18 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38.89 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  29.96 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  38.74 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.61 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.29 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.46 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  37.1 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  38.46 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  35.81 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  32.92 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 221 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 260 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  35.81 
 
 		 209 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 261 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 296 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 310 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  38.89 
 
 		 215 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  38.89 
 
 		 215 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 200 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.21 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  38.89 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  38.89 
 
 		 215 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  36 
 
 		 185 aa  79  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  38.89 
 
 		 215 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  38.89 
 
 		 215 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  38.89 
 
 		 215 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  41.18 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  39.62 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  37.96 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  38.24 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.27 
 
 		 163 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  35.45 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>