More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2070 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 350 aa  716    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  62.87 
 
 		 337 aa  437  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  60 
 
 		 349 aa  432  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  59.04 
 
 		 337 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  38.61 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  38.55 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  39.31 
 
 		 334 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  35.62 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  34.31 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  30.95 
 
 		 364 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  31.03 
 
 		 484 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  30.89 
 
 		 487 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  31.21 
 
 		 487 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  30.89 
 
 		 487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  31.49 
 
 		 304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  32.37 
 
 		 481 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  30.45 
 
 		 497 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  32.52 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  30.7 
 
 		 481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  32.9 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  30.28 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  30.21 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  30.06 
 
 		 485 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  29.82 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  30.16 
 
 		 485 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  37.36 
 
 		 481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  29.52 
 
 		 485 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  29.5 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  27.69 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  44.63 
 
 		 620 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  27.72 
 
 		 316 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.18 
 
 		 407 aa  95.9  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  36.87 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  29.82 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 		 468 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  45.22 
 
 		 369 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 466 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 209 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 		 420 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 457 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  46.6 
 
 		 623 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 236 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  43.14 
 
 		 217 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.16 
 
 		 217 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 209 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  44.12 
 
 		 209 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  40.87 
 
 		 630 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 217 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 		 454 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 459 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  41.75 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 219 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  43.14 
 
 		 212 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  43.14 
 
 		 215 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  43.14 
 
 		 215 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  43.14 
 
 		 215 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  43.14 
 
 		 215 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.59 
 
 		 422 aa  86.3  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  43.14 
 
 		 215 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  43.14 
 
 		 215 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  43.9 
 
 		 344 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  36.09 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  42.16 
 
 		 261 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 232 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  43.14 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  45.71 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  42.28 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  42.28 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.46 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  42.28 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  43 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  41.18 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  45.54 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 434 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  41.46 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  24.91 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  41.46 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 193 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>