More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0145 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  98.15 
 
 		 487 aa  991    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  96.3 
 
 		 487 aa  966    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 487 aa  1004    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  47.37 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  46.19 
 
 		 497 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  45.36 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  43.84 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  45.49 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  45.49 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 485 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  44.49 
 
 		 481 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  44.85 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  44.42 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  41.61 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  37.67 
 
 		 321 aa  178  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  35.95 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  37.63 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  32.68 
 
 		 331 aa  153  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 304 aa  147  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  33.44 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  31.21 
 
 		 350 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  30.28 
 
 		 337 aa  136  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  33.57 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  30.67 
 
 		 334 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  27.9 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  30.42 
 
 		 364 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  30.36 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  32.78 
 
 		 310 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  30.34 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  31.54 
 
 		 310 aa  91.3  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  30.99 
 
 		 316 aa  90.5  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.69 
 
 		 319 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 263 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 623 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 		 319 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 184 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  42.45 
 
 		 466 aa  87  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 210 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 		 261 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 		 163 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  39.25 
 
 		 327 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.25 
 
 		 344 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  42.06 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 217 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.88 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.07 
 
 		 172 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.25 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.93 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.25 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  37.3 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.25 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  41.51 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  41.51 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  41.51 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  41.51 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  41.51 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  41.51 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  41.51 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  39.25 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  41.51 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  38.58 
 
 		 537 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  37.88 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  37.88 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  35.94 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 221 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.17 
 
 		 260 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  41.41 
 
 		 351 aa  83.2  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.94 
 
 		 169 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  31.25 
 
 		 315 aa  83.2  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 217 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.09 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  45.28 
 
 		 166 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.94 
 
 		 176 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.16 
 
 		 170 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.14 
 
 		 196 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  45.28 
 
 		 167 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 163 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 244 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  37.24 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 240 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.28 
 
 		 179 aa  82.4  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 208 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.09 
 
 		 163 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.28 
 
 		 166 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.51 
 
 		 217 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  35.16 
 
 		 170 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  26.69 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  35.16 
 
 		 170 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  36.94 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.32 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 		 209 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  45.28 
 
 		 165 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.27 
 
 		 167 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.16 
 
 		 170 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 180 aa  81.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 200 aa  81.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>