More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1943 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  56.07 
 
 
179 aa  181  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  52.43 
 
 
180 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.26 
 
 
180 aa  175  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  50.86 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  51.98 
 
 
177 aa  169  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  48 
 
 
182 aa  167  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  48.04 
 
 
180 aa  167  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.04 
 
 
180 aa  167  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.15 
 
 
172 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  47.45 
 
 
179 aa  157  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.7 
 
 
169 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.15 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.15 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  46.15 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  46.15 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.7 
 
 
169 aa  151  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  46.7 
 
 
169 aa  151  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  56.3 
 
 
176 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  53.57 
 
 
169 aa  148  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  53.33 
 
 
169 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  65.05 
 
 
170 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.59 
 
 
169 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  47.34 
 
 
170 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2205  outer membrane protein, porin-associated lipoprotein  45.03 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.604308  hitchhiker  0.00226867 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.7 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  63.11 
 
 
170 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  63.11 
 
 
170 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  63.11 
 
 
170 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  63.11 
 
 
170 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  63.11 
 
 
170 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  63.11 
 
 
170 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  63.11 
 
 
170 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  61.17 
 
 
172 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  43.89 
 
 
175 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4052  OmpA/MotB  44.75 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.03 
 
 
173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.03 
 
 
173 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  42.54 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  40.61 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  40.61 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.61 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3831  peptidoglycan-associated lipoprotein  57.69 
 
 
182 aa  131  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  56.6 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  59.22 
 
 
184 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0302  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.38 
 
 
166 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.519391  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0562  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.89 
 
 
127 aa  125  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.39 
 
 
163 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2338  OmpA/MotB  41.76 
 
 
180 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000002945  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  53.51 
 
 
163 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0781  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.86 
 
 
170 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 
194 aa  121  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0274  OmpA/MotB domain-containing protein  52.38 
 
 
167 aa  121  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00497769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.59 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  55.34 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2228  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  38.5 
 
 
181 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.78 
 
 
199 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  55.34 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  54.46 
 
 
189 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  56.31 
 
 
177 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  48.21 
 
 
174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0567  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.37 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22731  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.86 
 
 
176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  57.28 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.61 
 
 
192 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  38.42 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0784  OmpA/MotB domain-containing protein  50.93 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0131111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  45.63 
 
 
165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1474  OmpA/MotB domain-containing protein  48.57 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.06 
 
 
184 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  36.76 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  40.67 
 
 
205 aa  108  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2867  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.6 
 
 
168 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.859200000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2955  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.6 
 
 
168 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000883314  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.96 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  48.04 
 
 
211 aa  107  8.000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1398  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.6 
 
 
168 aa  107  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000375397  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  53.4 
 
 
168 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1230  OmpA family protein  47.57 
 
 
215 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.337438  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  53.4 
 
 
179 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.53 
 
 
163 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  42 
 
 
172 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1069  outer membrane protein P6 precursor  36.26 
 
 
178 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.427526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.6 
 
 
187 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.03 
 
 
168 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  52.43 
 
 
169 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  51 
 
 
177 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  52.43 
 
 
166 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
167 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.43 
 
 
166 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  43.66 
 
 
135 aa  105  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.43 
 
 
165 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  52.43 
 
 
165 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  53.54 
 
 
174 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.43 
 
 
166 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.03 
 
 
168 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  52.94 
 
 
167 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.52 
 
 
171 aa  104  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0589  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
179 aa  104  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000303526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>