More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2043 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 349 aa  719    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  78.53 
 
 		 337 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  74.77 
 
 		 337 aa  525  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  62.74 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  43.94 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  39.14 
 
 		 321 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  37.36 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  36.57 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 331 aa  178  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  35.01 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  33.96 
 
 		 484 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  33.83 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  27.93 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  30.74 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  33.77 
 
 		 364 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  29.81 
 
 		 497 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  30.72 
 
 		 481 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  29.69 
 
 		 479 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.94 
 
 		 481 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  30.28 
 
 		 485 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  27.9 
 
 		 487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  27.9 
 
 		 487 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  28.53 
 
 		 487 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  29.65 
 
 		 485 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  29.69 
 
 		 485 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  29.34 
 
 		 485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  27.13 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  28.71 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  28 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  37.02 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.32 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  27.67 
 
 		 310 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 		 434 aa  96.3  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 468 aa  95.9  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 		 433 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 466 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.81 
 
 		 217 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 217 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 		 537 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  40.98 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  48.54 
 
 		 623 aa  92.8  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  45.1 
 
 		 209 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  44.12 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.57 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 209 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  46.67 
 
 		 432 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  43.86 
 
 		 310 aa  90.5  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 209 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 232 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 215 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  41.23 
 
 		 620 aa  89.7  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.12 
 
 		 212 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  43.14 
 
 		 214 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 217 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 454 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.78 
 
 		 466 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  42.73 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 215 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 215 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  43.14 
 
 		 215 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 		 630 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.53 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 214 aa  86.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  35.17 
 
 		 185 aa  86.3  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 333 aa  85.9  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  43.14 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  43.14 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  43.14 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  43.14 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  43.14 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  43.14 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.24 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  27.72 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  43.14 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.81 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  42.16 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.96 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.24 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.59 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  41.12 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  35.38 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  38.24 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  38.24 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  39.13 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  39.13 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  38.24 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.16 
 
 		 427 aa  82.8  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>