More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1579 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  100 
 
 
333 aa  685    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  43.94 
 
 
349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  43.83 
 
 
321 aa  229  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  42.14 
 
 
331 aa  215  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  40.66 
 
 
337 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
317 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  39.41 
 
 
337 aa  209  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  36.78 
 
 
334 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  36.95 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  38.2 
 
 
350 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  37.5 
 
 
484 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 
497 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 
479 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 
364 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  32.7 
 
 
364 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  32.91 
 
 
326 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  33.99 
 
 
485 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 
485 aa  149  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  34.68 
 
 
481 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  34.11 
 
 
481 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 
487 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  33.88 
 
 
487 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 
485 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  33.44 
 
 
487 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
485 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  33.55 
 
 
481 aa  135  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  32.3 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.15 
 
 
407 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  38.93 
 
 
640 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  39.11 
 
 
319 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  31.65 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  45.13 
 
 
620 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  46.67 
 
 
432 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  45.71 
 
 
434 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  29.26 
 
 
352 aa  93.2  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  51 
 
 
209 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  51 
 
 
209 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 
537 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 
360 aa  90.1  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  47 
 
 
209 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  48 
 
 
217 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 
468 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 
466 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  46.46 
 
 
417 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  29.12 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 
374 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  44.12 
 
 
420 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  46 
 
 
217 aa  85.9  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  46 
 
 
217 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  36.87 
 
 
630 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  39.64 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.12 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  49.06 
 
 
543 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.59 
 
 
466 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  46.08 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  28.88 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  44 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  44 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  44 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  44.12 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  44 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  44 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  44 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 
498 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  44.12 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  43.14 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  43.27 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  45.54 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 
459 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  42.06 
 
 
517 aa  82.8  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.86 
 
 
447 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.11 
 
 
542 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  33.95 
 
 
669 aa  82.4  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  49.5 
 
 
510 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  39.17 
 
 
420 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 
215 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.16 
 
 
240 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  39.6 
 
 
457 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  42.57 
 
 
320 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.94 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  27.72 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  37.86 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  47.17 
 
 
544 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.08 
 
 
890 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  44.66 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  43.43 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  37.98 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  42.31 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  38.68 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 
525 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  40.19 
 
 
510 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.94 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>