More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0594 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 479 aa  991    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  51.27 
 
 		 497 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  51.88 
 
 		 481 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  48.46 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  43.51 
 
 		 487 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  44.06 
 
 		 487 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  43.84 
 
 		 487 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  42.14 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  41.93 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  41.81 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  42.14 
 
 		 485 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.04 
 
 		 481 aa  363  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  35.14 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  33.22 
 
 		 321 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  30.92 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  33.68 
 
 		 317 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  30.74 
 
 		 331 aa  136  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  33.21 
 
 		 364 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  33.21 
 
 		 304 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  30.28 
 
 		 350 aa  128  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  29.05 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  28.4 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  29.69 
 
 		 349 aa  123  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  28.92 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  28.57 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  27.67 
 
 		 326 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  40.71 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  27.91 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 623 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.4 
 
 		 344 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.73 
 
 		 321 aa  90.9  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 		 310 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 263 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 263 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.82 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  25.6 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  39.62 
 
 		 327 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 		 262 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  36.92 
 
 		 422 aa  87  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  38.1 
 
 		 429 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  35.11 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 263 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  35.11 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  35.88 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 261 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  35.11 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  35.11 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.11 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  43.27 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.62 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.05 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  33.33 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.78 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  27.39 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  42.86 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 223 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.45 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 230 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 208 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.96 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.27 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  35.56 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  34.82 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  36.84 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  36.84 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.5 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  38.68 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  38.68 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  38.68 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.82 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  38.68 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.82 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  38.68 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  38.68 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 227 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  38.68 
 
 		 316 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  44.57 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  36.61 
 
 		 252 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.71 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  36.27 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  38.68 
 
 		 261 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  28.76 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  37.5 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.54 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  32.31 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  34.75 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>