More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0586 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 381 aa  768    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  45.26 
 
 		 380 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  34.66 
 
 		 401 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.64 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32.29 
 
 		 447 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.59 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  35.78 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  33.1 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.86 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.72 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  34.04 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  32.54 
 
 		 344 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.56 
 
 		 350 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.56 
 
 		 350 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  29.35 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  31.75 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  34.64 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  30.95 
 
 		 344 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  30.95 
 
 		 344 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  31.38 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  33.03 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  49.71 
 
 		 294 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  32.01 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  29.12 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  28.57 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  28.54 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  32.44 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  32.25 
 
 		 403 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  30.08 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.54 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  29.43 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  33.55 
 
 		 402 aa  129  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  35.38 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  29.62 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  34.98 
 
 		 333 aa  127  5e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 373 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  43.26 
 
 		 543 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  43.4 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  48.03 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  29.48 
 
 		 366 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  43.45 
 
 		 209 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  42.77 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 367 aa  123  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  41.4 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  41.4 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.7 
 
 		 542 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  40.22 
 
 		 510 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.58 
 
 		 623 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  42.7 
 
 		 544 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  31.15 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  47.86 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  43.75 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  25.82 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  28.47 
 
 		 373 aa  117  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  36.98 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  29.53 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  41.89 
 
 		 201 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  29.53 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  37.82 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  35.27 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 440 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  43.06 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 200 aa  112  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  48.21 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  36.55 
 
 		 201 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  46.96 
 
 		 210 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.06 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 506 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 202 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  42 
 
 		 202 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 		 202 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  46.49 
 
 		 466 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  28.46 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  35.68 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  33.82 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1987 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  38.67 
 
 		 202 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  39.19 
 
 		 202 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  35.26 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  30.74 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  36.81 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  39.19 
 
 		 185 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  37.95 
 
 		 201 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  39.86 
 
 		 202 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 486 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  36.99 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  39.86 
 
 		 202 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 201 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  38.07 
 
 		 445 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  36.49 
 
 		 201 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  27.42 
 
 		 459 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.16 
 
 		 201 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  30.3 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>