More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0366 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  737    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0365  OmpA domain-containing protein  58.86 
 
 		 181 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0769021  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  33.15 
 
 		 468 aa  179  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  30.57 
 
 		 401 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  32.88 
 
 		 466 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  29.72 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  29.75 
 
 		 351 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  29.34 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  30.61 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  30.03 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  28.17 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  28.29 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  28.29 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  29.17 
 
 		 459 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  27.97 
 
 		 380 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  29.36 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  29.17 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  28.7 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  27.86 
 
 		 344 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  27.86 
 
 		 344 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  55.24 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  27.27 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  30.37 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  30.36 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  29.8 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  28.94 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  27.37 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.17 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  27.3 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.45 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  28.71 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  26.92 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.72 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 210 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  34.38 
 
 		 457 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  25.97 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  29.52 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  41.9 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  25.59 
 
 		 368 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  35.86 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 434 aa  95.9  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  27.76 
 
 		 331 aa  95.9  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  25.07 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  25 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  42.99 
 
 		 218 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  26.04 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  26.56 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  26.62 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  44.23 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  43.52 
 
 		 368 aa  93.2  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  40.74 
 
 		 370 aa  92.8  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 417 aa  92.8  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 432 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  43.81 
 
 		 201 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  40.8 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  34.07 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  36.51 
 
 		 240 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 202 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 202 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 185 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  25.94 
 
 		 333 aa  89.7  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 376 aa  89.4  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 202 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 202 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 		 236 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  26.84 
 
 		 348 aa  88.6  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  39.53 
 
 		 656 aa  89  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 223 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 261 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 216 aa  87.4  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 263 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 263 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 263 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  24.22 
 
 		 377 aa  86.3  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 262 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  40.57 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 201 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  23.56 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 200 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.57 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  40.95 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  27.1 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  39.05 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.57 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  46.59 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>