More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03195 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  100 
 
 		 478 aa  981    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  47.9 
 
 		 487 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  46.17 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  46.95 
 
 		 727 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  44.94 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  46.59 
 
 		 320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  41.49 
 
 		 1987 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  45.97 
 
 		 1755 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  41.45 
 
 		 386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.45 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  41.09 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.81 
 
 		 447 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 543 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.81 
 
 		 542 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.51 
 
 		 427 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.91 
 
 		 374 aa  171  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.41 
 
 		 623 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 544 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 637 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.76 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.42 
 
 		 319 aa  159  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  43.96 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.37 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.71 
 
 		 506 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  36.96 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  44.66 
 
 		 429 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  42.13 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  43.13 
 
 		 401 aa  140  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  41.2 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  39.55 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  37.31 
 
 		 1264 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  46.1 
 
 		 344 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  46.1 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  44.81 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  44.81 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  44.81 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  44.81 
 
 		 344 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  44.81 
 
 		 344 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  44.81 
 
 		 344 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  44.81 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  43.12 
 
 		 440 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  44.67 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 445 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40.98 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  41.11 
 
 		 380 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  42.38 
 
 		 335 aa  118  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  44.37 
 
 		 445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  46.26 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.75 
 
 		 240 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  36.98 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  39.26 
 
 		 314 aa  113  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  42.21 
 
 		 375 aa  113  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  42.21 
 
 		 375 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  44.92 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 570 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  41.67 
 
 		 365 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 322 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  43.33 
 
 		 337 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  49.04 
 
 		 225 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  49.52 
 
 		 620 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  40.25 
 
 		 209 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  40.91 
 
 		 394 aa  107  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  45.37 
 
 		 224 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  42 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  50.49 
 
 		 236 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  48.51 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  40.26 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  36.87 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  39.26 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  40.36 
 
 		 333 aa  104  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  49.52 
 
 		 525 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  28.43 
 
 		 671 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 237 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  45.87 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  45.63 
 
 		 233 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 		 205 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.48 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  37.76 
 
 		 266 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  43.27 
 
 		 226 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  50.5 
 
 		 229 aa  101  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 		 210 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  47.57 
 
 		 215 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  50.5 
 
 		 333 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 239 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  45.63 
 
 		 230 aa  99.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  45.87 
 
 		 193 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 		 216 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  46.15 
 
 		 217 aa  98.2  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  49.5 
 
 		 333 aa  98.2  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  48.54 
 
 		 233 aa  97.8  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  46.15 
 
 		 217 aa  97.8  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.54 
 
 		 407 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  32.74 
 
 		 264 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 376 aa  97.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  44.34 
 
 		 640 aa  96.7  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 481 aa  96.3  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>