More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0810 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 466 aa  953    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  65.88 
 
 		 457 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  59.49 
 
 		 454 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  57.95 
 
 		 459 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  56.55 
 
 		 459 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  52.6 
 
 		 468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  50.94 
 
 		 466 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.22 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.19 
 
 		 427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  55.41 
 
 		 429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  33.43 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  31.01 
 
 		 345 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  30.64 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  31.1 
 
 		 344 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  30.06 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  31.1 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  31.1 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  31.1 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  31.55 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  29.18 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  47.87 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  33.89 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  62.96 
 
 		 333 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  61.11 
 
 		 333 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  30.49 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  30.49 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  49.42 
 
 		 434 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  29.77 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  43.06 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  31.86 
 
 		 335 aa  143  8e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  47.02 
 
 		 443 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  29.14 
 
 		 319 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  31.38 
 
 		 394 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  29.77 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  31.82 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  29.05 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  27.3 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  27.72 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  36.6 
 
 		 1793 aa  126  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  39.41 
 
 		 314 aa  126  9e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  46.79 
 
 		 210 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  27.62 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  29.77 
 
 		 363 aa  120  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  26.11 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  29.97 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  27.19 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  29.11 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  50.47 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  49.53 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  37.09 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  46.96 
 
 		 209 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  45.76 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  43.65 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  44.83 
 
 		 209 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  29.43 
 
 		 331 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.92 
 
 		 212 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  51.43 
 
 		 218 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  44.83 
 
 		 209 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  36.57 
 
 		 240 aa  107  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  43.97 
 
 		 209 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  28.28 
 
 		 352 aa  106  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  46.67 
 
 		 694 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  47.75 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  30.99 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  42.11 
 
 		 331 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05164  hypothetical protein  32.49 
 
 		 301 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 		 169 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  42.62 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  28.49 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  43.64 
 
 		 223 aa  100  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  25.54 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  35.23 
 
 		 290 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  44.76 
 
 		 224 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  49.04 
 
 		 215 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  43.52 
 
 		 640 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  47.52 
 
 		 231 aa  97.8  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 416 aa  97.8  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.23 
 
 		 230 aa  97.8  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 		 296 aa  97.8  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 288 aa  97.8  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  46.3 
 
 		 623 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  44.54 
 
 		 537 aa  97.1  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  46.79 
 
 		 241 aa  96.7  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  46.79 
 
 		 241 aa  96.7  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  45.1 
 
 		 364 aa  96.7  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 360 aa  96.7  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  34.68 
 
 		 321 aa  96.7  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 202 aa  95.9  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  45.71 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  37.91 
 
 		 326 aa  96.3  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  44.44 
 
 		 620 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 201 aa  95.9  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  44.55 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  43.24 
 
 		 217 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.12 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  41.09 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>