More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1221 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  67.78 
 
 		 239 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  69.04 
 
 		 264 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  68.05 
 
 		 237 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  67.78 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  63.29 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  46.5 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  38.91 
 
 		 210 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  38.91 
 
 		 210 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  46.5 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  53.77 
 
 		 219 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  45.68 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  45.68 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  45.68 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  45 
 
 		 344 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  45.51 
 
 		 335 aa  126  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  53.77 
 
 		 218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  45.62 
 
 		 344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  53.77 
 
 		 218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  47.06 
 
 		 420 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  45.62 
 
 		 344 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  45.62 
 
 		 345 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  45.62 
 
 		 344 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  45.62 
 
 		 344 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  45 
 
 		 350 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  45 
 
 		 350 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  45.62 
 
 		 344 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  43.83 
 
 		 375 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  52.83 
 
 		 210 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  51.89 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  52.83 
 
 		 212 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  51.89 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  43.27 
 
 		 429 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  44.44 
 
 		 427 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.61 
 
 		 447 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  43.75 
 
 		 351 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  43.79 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  43.95 
 
 		 445 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.2 
 
 		 607 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  51.89 
 
 		 219 aa  118  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  40.76 
 
 		 376 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  46.77 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.75 
 
 		 478 aa  115  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  41.21 
 
 		 394 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  47.41 
 
 		 207 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  35.08 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  48.25 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  41.21 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  38.56 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.38 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.62 
 
 		 319 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  39.75 
 
 		 337 aa  112  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  50.89 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  41.21 
 
 		 403 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  39.75 
 
 		 337 aa  111  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  40.99 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  37.7 
 
 		 266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  50.44 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  37.85 
 
 		 417 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  48.65 
 
 		 294 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  52.58 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  39.51 
 
 		 449 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 440 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  45.95 
 
 		 209 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  46.85 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  49.11 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  45.38 
 
 		 205 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.53 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  46.85 
 
 		 209 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  47.32 
 
 		 537 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  49.57 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  39.49 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  49.11 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  39.02 
 
 		 1755 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  49.11 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  42.14 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 		 362 aa  104  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  45.3 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  36.72 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  48.11 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  48.57 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  39.88 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.8 
 
 		 623 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  48.11 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  49.15 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  48.72 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  49.15 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  48.21 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.14 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  44.14 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  46.85 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.51 
 
 		 407 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  45.87 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  46.79 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  42.86 
 
 		 415 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>