More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1944 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 445 aa  907    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  51.82 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  46.93 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  46.3 
 
 		 543 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  46.3 
 
 		 544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  27.98 
 
 		 502 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.06 
 
 		 542 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.21 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  42.86 
 
 		 478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.52 
 
 		 294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.51 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  38.99 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.36 
 
 		 510 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  35.68 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  40.74 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.79 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 244 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.79 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  46.23 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  36.53 
 
 		 240 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  43.2 
 
 		 277 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  28.06 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  42.97 
 
 		 220 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  42.97 
 
 		 220 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  42.97 
 
 		 220 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  42.97 
 
 		 220 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  42.97 
 
 		 220 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.16 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.74 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.26 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  37.74 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.32 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  40.51 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  37.74 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  37.74 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.52 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  39.26 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.36 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  32.74 
 
 		 458 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  40.37 
 
 		 337 aa  104  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3360  OmpA/MotB domain protein  26.51 
 
 		 484 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  35.83 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  34.07 
 
 		 490 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  40.62 
 
 		 209 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 		 1026 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  38.07 
 
 		 381 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  36.47 
 
 		 239 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  46.23 
 
 		 694 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  42.19 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  42.19 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  38.65 
 
 		 189 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  42.19 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  42.19 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  42.19 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  42.19 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  42.19 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  42.19 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  35.98 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  42.19 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  37.74 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  32.34 
 
 		 623 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  41.53 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  34.81 
 
 		 506 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  42.19 
 
 		 220 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 		 320 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  36.69 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 		 222 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.93 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  35.19 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  42.19 
 
 		 220 aa  100  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  36.65 
 
 		 320 aa  100  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  40.68 
 
 		 310 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  41.22 
 
 		 424 aa  99.8  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.84 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  40.68 
 
 		 310 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 		 316 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  42.19 
 
 		 217 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 		 316 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  38.27 
 
 		 403 aa  98.2  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  38.76 
 
 		 221 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.83 
 
 		 320 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 537 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  50.5 
 
 		 231 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  39.83 
 
 		 310 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  39.83 
 
 		 310 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  36.81 
 
 		 487 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  39.83 
 
 		 310 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  39.83 
 
 		 310 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  39.83 
 
 		 310 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  36.14 
 
 		 637 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 316 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  33.93 
 
 		 365 aa  97.1  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  36.71 
 
 		 380 aa  97.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 		 193 aa  97.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>