More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0800 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 362 aa  736    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  84.74 
 
 		 365 aa  616  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  68.5 
 
 		 375 aa  502  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  68.77 
 
 		 375 aa  504  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35.36 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35.36 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  37.28 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  34.15 
 
 		 345 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.88 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  36.56 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  34.6 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  31.79 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  53.95 
 
 		 375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  34.6 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  34.6 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  34.6 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  32.7 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  50.68 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.16 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  47.02 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  30.21 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  44.37 
 
 		 671 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  36.08 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  45.68 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  35.83 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  46.54 
 
 		 429 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  45.04 
 
 		 594 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  43.15 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.88 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.39 
 
 		 266 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  27.34 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  43.38 
 
 		 679 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  30.59 
 
 		 403 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  28.16 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  34.85 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  29.89 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  51.85 
 
 		 179 aa  109  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40 
 
 		 478 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.52 
 
 		 244 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  30.75 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 506 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  51.85 
 
 		 178 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  30.6 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  49.15 
 
 		 233 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  40.74 
 
 		 420 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  52.78 
 
 		 200 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.48 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  40.12 
 
 		 490 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  26.21 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  46.96 
 
 		 620 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  35.83 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  27.69 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  38.56 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  39.74 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  43.75 
 
 		 640 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  46.36 
 
 		 226 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40.13 
 
 		 231 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  45.67 
 
 		 366 aa  99.4  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  38.16 
 
 		 230 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.16 
 
 		 230 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.26 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  37.95 
 
 		 445 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  36.9 
 
 		 264 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  29.9 
 
 		 328 aa  97.8  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  43.86 
 
 		 463 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  47.32 
 
 		 217 aa  96.3  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  45.95 
 
 		 230 aa  96.3  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  34.86 
 
 		 252 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 		 537 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  45.24 
 
 		 210 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  36.18 
 
 		 230 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  33.93 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  36.31 
 
 		 239 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.71 
 
 		 623 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  40.91 
 
 		 509 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  38.85 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  43.22 
 
 		 223 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 650 aa  94  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  28.06 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  38.69 
 
 		 464 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.13 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  38.55 
 
 		 637 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.9 
 
 		 321 aa  93.2  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  39.69 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  42.24 
 
 		 694 aa  93.2  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  44.26 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  43.97 
 
 		 757 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.42 
 
 		 673 aa  92.4  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  27.9 
 
 		 468 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 1755 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.73 
 
 		 170 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 237 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  43.85 
 
 		 225 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 648 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>