More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0727 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  63.33 
 
 
179 aa  214  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  51.85 
 
 
362 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  48.15 
 
 
365 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  44.68 
 
 
366 aa  99.4  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  49.59 
 
 
375 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  46.83 
 
 
210 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  46.83 
 
 
210 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  42.62 
 
 
217 aa  91.7  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  47.27 
 
 
219 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  48.67 
 
 
376 aa  87.4  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  35.57 
 
 
671 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  46.36 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  40.5 
 
 
252 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  44.17 
 
 
345 aa  85.9  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 
594 aa  85.5  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 
242 aa  85.1  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  45.45 
 
 
214 aa  84.3  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  46.36 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  44.55 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 
586 aa  82  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 
231 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 
210 aa  80.9  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  41.82 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  41.8 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  41.82 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.02 
 
 
607 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 
375 aa  79  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  40.74 
 
 
375 aa  78.6  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  42.34 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  39.23 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  44.14 
 
 
420 aa  77.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  50.62 
 
 
239 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.64 
 
 
240 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.82 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.53 
 
 
447 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  41.67 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.28 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  38.74 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  37.27 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  37.4 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.74 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  29.1 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  40.68 
 
 
433 aa  74.3  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  40.16 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 
525 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.1 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  41.23 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  38.6 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  39.09 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40.83 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  39.09 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40.83 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 
445 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  38.89 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  34.92 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  39.64 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  34.48 
 
 
669 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.8 
 
 
466 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  31.48 
 
 
550 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.37 
 
 
429 aa  72  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.17 
 
 
344 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  37.84 
 
 
430 aa  72  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  38.58 
 
 
510 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  34.23 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  32.58 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  39.2 
 
 
457 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  34.92 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  48.15 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  34.92 
 
 
247 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  34.92 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  34.92 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  48.15 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>