More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02680 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  100 
 
 		 430 aa  832    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  42.37 
 
 		 671 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  45.69 
 
 		 217 aa  99.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  43.59 
 
 		 252 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  40.5 
 
 		 586 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  45.37 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 179 aa  90.1  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 594 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 		 362 aa  90.1  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.12 
 
 		 244 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.61 
 
 		 230 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 		 219 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 		 242 aa  87.8  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.97 
 
 		 219 aa  86.7  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 229 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.33 
 
 		 407 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 679 aa  86.7  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  36.69 
 
 		 641 aa  86.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  44.92 
 
 		 231 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 		 219 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  42.02 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  42.24 
 
 		 694 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  42.02 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  45.28 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  45.76 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 		 218 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 		 218 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  44.86 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.03 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.03 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  46.32 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  43.22 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  42.61 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  47.79 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.16 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  39.84 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  41.82 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  40.62 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  38.12 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  43.59 
 
 		 217 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  41.27 
 
 		 620 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  39.84 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  45.79 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 187 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 		 166 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  40.6 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  38.41 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  41.32 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  41.32 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  37.82 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.23 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  42.28 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  36.28 
 
 		 903 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  40.52 
 
 		 160 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.36 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  43.93 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  37.3 
 
 		 669 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  41.22 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  41.27 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  45.87 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40.17 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  34.01 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 		 200 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  42.73 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  40 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 		 525 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 630 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  36.64 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  30.41 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.01 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  36.97 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4096  OmpA/MotB domain protein  39.2 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287994  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  43.64 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  52.63 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.01 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  39.32 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.71 
 
 		 607 aa  76.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>