More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1156 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 322 aa  672    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 		 671 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  39.34 
 
 		 679 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  52.22 
 
 		 586 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  38.71 
 
 		 365 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  45.79 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  44.23 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  41.9 
 
 		 656 aa  90.9  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  37.7 
 
 		 594 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  33.93 
 
 		 509 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  41.09 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  46.15 
 
 		 466 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  46.3 
 
 		 630 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 176 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  38.69 
 
 		 1793 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  46.15 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  46.15 
 
 		 429 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.82 
 
 		 266 aa  86.3  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  37.69 
 
 		 510 aa  86.3  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 193 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  40.74 
 
 		 252 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  41.67 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  42.45 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  37.96 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40.54 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  47.25 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  43.93 
 
 		 620 aa  83.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 468 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  44.34 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  39.82 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  37.68 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  39.47 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 537 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  41.67 
 
 		 640 aa  82.4  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  46.67 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  30.89 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  44.44 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  37.82 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.37 
 
 		 707 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  37.17 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  40.19 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  35.83 
 
 		 641 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.17 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  36.09 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  36.7 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  46.6 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  37.93 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  39.42 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 537 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.45 
 
 		 407 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 498 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 533 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  32.03 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  33.33 
 
 		 631 aa  79.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 543 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.06 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  36.11 
 
 		 710 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 175 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  35.88 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  38.18 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.81 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  36.7 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.08 
 
 		 673 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>