More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1004 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 175 aa  349  8.999999999999999e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  47.37 
 
 		 445 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  41.88 
 
 		 525 aa  98.2  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  44.34 
 
 		 637 aa  97.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  40.29 
 
 		 1793 aa  94.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  43.27 
 
 		 294 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 449 aa  92.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  44.12 
 
 		 478 aa  92  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  39.57 
 
 		 440 aa  91.7  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 		 215 aa  91.7  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 374 aa  91.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 		 189 aa  91.3  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  39.32 
 
 		 517 aa  91.3  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  45 
 
 		 360 aa  90.1  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  30.68 
 
 		 388 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 263 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  42.06 
 
 		 320 aa  89.4  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 263 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 468 aa  88.2  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  38.05 
 
 		 670 aa  88.2  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 459 aa  87.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 335 aa  86.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  40.35 
 
 		 398 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 1026 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  43.69 
 
 		 464 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 594 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 319 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.84 
 
 		 217 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 344 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 		 217 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  35 
 
 		 233 aa  85.9  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 262 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  34.81 
 
 		 225 aa  85.9  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 230 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.52 
 
 		 240 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 		 673 aa  85.1  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  40.2 
 
 		 463 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 230 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 230 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  48.24 
 
 		 537 aa  84.7  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  41.03 
 
 		 294 aa  85.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 263 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 219 aa  85.1  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 		 243 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.85 
 
 		 422 aa  84.3  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 226 aa  84.3  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  49.52 
 
 		 487 aa  84  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  38.24 
 
 		 311 aa  84  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.3 
 
 		 543 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  40.78 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35.59 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  37.59 
 
 		 466 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  35.56 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  37.01 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.3 
 
 		 542 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  38.3 
 
 		 544 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 		 441 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  39.32 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  40.17 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  35.09 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  36 
 
 		 658 aa  82.4  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  38.14 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  37.01 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  37.01 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  37.01 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  35.96 
 
 		 656 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  37.01 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 445 aa  82  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  37.01 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  39.67 
 
 		 454 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 630 aa  82  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  37.01 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  39.32 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  44.23 
 
 		 402 aa  81.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  37.01 
 
 		 316 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 261 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 537 aa  81.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  32.59 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  35.04 
 
 		 510 aa  81.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 315 aa  81.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.87 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 464 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  40.78 
 
 		 260 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  36.52 
 
 		 533 aa  80.9  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  33.81 
 
 		 613 aa  80.9  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  39.25 
 
 		 640 aa  80.9  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  43.14 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  39.53 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>