More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3888 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  95.96 
 
 
543 aa  1008    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
544 aa  1107    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  93.75 
 
 
542 aa  990    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 
510 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  31.05 
 
 
1987 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  32.38 
 
 
1755 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  30.26 
 
 
623 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 
440 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  47.51 
 
 
374 aa  180  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  47.37 
 
 
456 aa  179  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  48.34 
 
 
320 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  48.1 
 
 
487 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.74 
 
 
478 aa  167  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  44.97 
 
 
506 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
727 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  41.83 
 
 
386 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  41.43 
 
 
386 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.28 
 
 
294 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  32.63 
 
 
637 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.24 
 
 
412 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.63 
 
 
427 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  43.87 
 
 
428 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.74 
 
 
319 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.79 
 
 
447 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.33 
 
 
420 aa  150  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  47.49 
 
 
402 aa  149  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  46.45 
 
 
429 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  34.37 
 
 
458 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  33 
 
 
417 aa  146  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  29.65 
 
 
498 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  39.7 
 
 
1264 aa  140  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  37.4 
 
 
490 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  27.09 
 
 
540 aa  133  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  46.3 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  46.78 
 
 
440 aa  130  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  28.55 
 
 
570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  42.7 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  41.48 
 
 
380 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  38.25 
 
 
314 aa  117  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  41.14 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  46.61 
 
 
193 aa  113  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  42.07 
 
 
388 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  42.38 
 
 
350 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  42.38 
 
 
350 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
209 aa  106  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  41.72 
 
 
351 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  42.38 
 
 
344 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.38 
 
 
344 aa  104  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  41.06 
 
 
344 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  41.06 
 
 
344 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  41.06 
 
 
344 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  36.32 
 
 
322 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  41.06 
 
 
344 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 
360 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.4 
 
 
345 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  38.96 
 
 
367 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  48.08 
 
 
510 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  46.36 
 
 
230 aa  100  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  42.11 
 
 
375 aa  99.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  44.92 
 
 
669 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 
375 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 
537 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  39.74 
 
 
345 aa  99.4  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  42.38 
 
 
375 aa  99.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  50.45 
 
 
222 aa  98.6  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  46.15 
 
 
694 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 
459 aa  97.8  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  39.74 
 
 
445 aa  97.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  36.67 
 
 
240 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 
244 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  46.3 
 
 
464 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  48.04 
 
 
311 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  46.15 
 
 
233 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  41.38 
 
 
424 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 
236 aa  94.7  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  35.36 
 
 
366 aa  94.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  44.14 
 
 
214 aa  93.6  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  37.5 
 
 
653 aa  93.6  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38 
 
 
337 aa  93.2  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  41.5 
 
 
335 aa  93.2  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 
222 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.98 
 
 
607 aa  93.2  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  47.75 
 
 
227 aa  92.8  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  39.19 
 
 
365 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
215 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  40.87 
 
 
525 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  45.54 
 
 
212 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0587  outer membrane protein, OmpA family  39.09 
 
 
212 aa  92.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536504  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
215 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  34.05 
 
 
239 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  43.24 
 
 
215 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.58 
 
 
376 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  45.19 
 
 
517 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  44.14 
 
 
217 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  47.12 
 
 
277 aa  92  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  43.93 
 
 
288 aa  91.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
537 aa  91.3  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 
320 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>