More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1035 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 360 aa  738    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 456 aa  135  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  45.08 
 
 		 478 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.55 
 
 		 542 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  46.67 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  43.97 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  43.55 
 
 		 543 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  46.53 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  48.11 
 
 		 169 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.6 
 
 		 217 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  46.6 
 
 		 217 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 		 544 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 		 209 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  45.54 
 
 		 209 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 		 209 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 229 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  32.54 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  50 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  49.04 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  29.85 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  49.04 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.66 
 
 		 890 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  41.88 
 
 		 229 aa  100  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  43.81 
 
 		 517 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.55 
 
 		 212 aa  99.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  29.96 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  29.67 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  42.99 
 
 		 1987 aa  99.4  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 		 671 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  34.9 
 
 		 704 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  43.09 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 420 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  29.59 
 
 		 344 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 525 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  45.45 
 
 		 466 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.92 
 
 		 407 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 193 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  35.17 
 
 		 626 aa  96.3  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.57 
 
 		 261 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.57 
 
 		 261 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  32.75 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  29.21 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 260 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 		 175 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  30.15 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  32.46 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 231 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  39.32 
 
 		 229 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 217 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 454 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  40.78 
 
 		 215 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  40.78 
 
 		 215 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  40.78 
 
 		 215 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  40.78 
 
 		 215 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  40.78 
 
 		 215 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  31.13 
 
 		 327 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  40.78 
 
 		 215 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  41.75 
 
 		 261 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 		 416 aa  93.6  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  41.58 
 
 		 233 aa  93.2  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.59 
 
 		 230 aa  93.2  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  45 
 
 		 175 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 		 434 aa  93.2  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  45.19 
 
 		 447 aa  93.2  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 		 270 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  40.95 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  39.82 
 
 		 229 aa  92.8  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  40.78 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  39.81 
 
 		 224 aa  92.8  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  36.55 
 
 		 457 aa  92.8  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.27 
 
 		 417 aa  92.8  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  35.66 
 
 		 236 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  43.56 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.89 
 
 		 218 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 466 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 459 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  38.89 
 
 		 260 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  34.56 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 333 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.68 
 
 		 707 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 459 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 216 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 487 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  31.58 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 229 aa  90.5  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 		 215 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  42.73 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 226 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  38.53 
 
 		 640 aa  90.5  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 443 aa  90.1  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 445 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 221 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 331 aa  89.7  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 630 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>