More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1489 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 229 aa  458  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  71.18 
 
 		 229 aa  298  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  71.18 
 
 		 229 aa  293  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  82.53 
 
 		 229 aa  288  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  69.43 
 
 		 229 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  71.05 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  64.19 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  49.48 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  47.31 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  52.67 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  46.48 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  38.74 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  47.16 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  41.26 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  45.03 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  41.48 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40.38 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  48.94 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.31 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  39.51 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  39.51 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  37.22 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  37.78 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.66 
 
 		 205 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.8 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  38.03 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  37.56 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  38.46 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  40.79 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  40.88 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  35.75 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  44.88 
 
 		 344 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.43 
 
 		 351 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  38.1 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  44.88 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.08 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  44.88 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  40.09 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  44.88 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  44.88 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  51.89 
 
 		 331 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  36.32 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  38.51 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.61 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41.98 
 
 		 337 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  40 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  40.67 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  38.8 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  43.57 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  42.66 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  42.03 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.31 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  42.52 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  43.31 
 
 		 344 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  40.71 
 
 		 337 aa  101  8e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  50.49 
 
 		 288 aa  101  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  37.79 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  40.64 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  39.86 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  38.68 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  45.3 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.25 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  48.51 
 
 		 321 aa  99.8  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  42.22 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 360 aa  99  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  45.61 
 
 		 327 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 319 aa  98.6  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  35.02 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  35.02 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  35.02 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  35.02 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  39.55 
 
 		 166 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.52 
 
 		 447 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 296 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  37.06 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  37.06 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  37.06 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  37.06 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  36.48 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  37.06 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  42.45 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  39.86 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.96 
 
 		 248 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  39.86 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  40.16 
 
 		 348 aa  95.5  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>