More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0282 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
230 aa  458  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  65.2 
 
 
233 aa  282  4.0000000000000003e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  50.43 
 
 
231 aa  174  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  43.17 
 
 
236 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  48.26 
 
 
225 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 
209 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 
229 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  44.58 
 
 
233 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  44.14 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 
229 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  40.64 
 
 
229 aa  138  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  45.4 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  45.78 
 
 
229 aa  126  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  36.65 
 
 
225 aa  125  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  42.66 
 
 
215 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  34.98 
 
 
218 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  35.29 
 
 
215 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  43.78 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  32.89 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  33.04 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  41.25 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  41.84 
 
 
226 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  43.26 
 
 
222 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  44.72 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  41.21 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  33.03 
 
 
223 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  35.68 
 
 
225 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.18 
 
 
224 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  35.4 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  36.04 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  35.39 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  36.04 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  40.43 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  31.86 
 
 
231 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  35.23 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.14 
 
 
230 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  34.83 
 
 
228 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.39 
 
 
296 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
223 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  35.14 
 
 
228 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  40.41 
 
 
218 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  35.03 
 
 
224 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  38.73 
 
 
215 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 
218 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  36.88 
 
 
222 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  32.59 
 
 
215 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  37.16 
 
 
217 aa  105  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 
219 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  36.04 
 
 
219 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  36.04 
 
 
219 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  36.04 
 
 
219 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  36.04 
 
 
219 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  36.04 
 
 
219 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  34.53 
 
 
222 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  35 
 
 
220 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  35 
 
 
220 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  35 
 
 
220 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  35 
 
 
220 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 
230 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  35 
 
 
220 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  37.76 
 
 
221 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  39.72 
 
 
224 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 
230 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  35.47 
 
 
224 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 
230 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  39.01 
 
 
219 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  40.28 
 
 
227 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  35.59 
 
 
219 aa  101  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 
236 aa  101  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  38.3 
 
 
228 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  34.38 
 
 
223 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  29.68 
 
 
216 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  29.68 
 
 
216 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  36.11 
 
 
217 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  37.41 
 
 
403 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  33.49 
 
 
218 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  49.02 
 
 
188 aa  98.6  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  36.25 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  37.06 
 
 
220 aa  98.6  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 
222 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  37.06 
 
 
243 aa  98.2  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  40.91 
 
 
331 aa  98.2  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  37.78 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  47.17 
 
 
187 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  43.09 
 
 
429 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.9 
 
 
707 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.1 
 
 
319 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  32.23 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  34.09 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  39.44 
 
 
230 aa  96.7  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>