More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0439 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
225 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  50.93 
 
 
236 aa  210  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  57.67 
 
 
263 aa  201  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  48.26 
 
 
230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  46.22 
 
 
233 aa  181  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  48.57 
 
 
209 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  46.12 
 
 
229 aa  159  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  44.59 
 
 
233 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  45.74 
 
 
223 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  46.4 
 
 
229 aa  148  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  48.25 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  47 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  47.35 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  48.59 
 
 
229 aa  138  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  45.13 
 
 
229 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  43.6 
 
 
228 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  43.6 
 
 
228 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  39.44 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  38.54 
 
 
241 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  41.4 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  43.31 
 
 
224 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.46 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  34.88 
 
 
231 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.89 
 
 
205 aa  118  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  41.61 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  36.15 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  32.88 
 
 
228 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  32.88 
 
 
228 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  32.88 
 
 
228 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  41.18 
 
 
226 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  38.86 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  35.19 
 
 
221 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  38.06 
 
 
223 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  36.94 
 
 
222 aa  108  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.27 
 
 
223 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  35.48 
 
 
224 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.32 
 
 
215 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  38.26 
 
 
286 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  43.28 
 
 
200 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.3 
 
 
218 aa  105  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  38.84 
 
 
224 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  34.13 
 
 
230 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  34.13 
 
 
230 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 
230 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  34.13 
 
 
230 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  40.58 
 
 
175 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  41.91 
 
 
208 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  42.22 
 
 
219 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  35.62 
 
 
223 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  33.99 
 
 
217 aa  102  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
216 aa  101  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
215 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 
296 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  39.87 
 
 
205 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  35.41 
 
 
225 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  49.54 
 
 
344 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  35.42 
 
 
217 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  48.62 
 
 
327 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 
244 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  46.15 
 
 
261 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  46.15 
 
 
261 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  38.24 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  49.54 
 
 
344 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  49.54 
 
 
344 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  35.14 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.96 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  38.24 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  45.63 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  32.06 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  49.11 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  45.13 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  44.72 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  39.86 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  47.17 
 
 
351 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  36.5 
 
 
230 aa  95.9  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  33.8 
 
 
228 aa  95.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  35.9 
 
 
225 aa  95.5  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  33.82 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  37.68 
 
 
222 aa  95.1  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.23 
 
 
188 aa  94.7  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 
222 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 
230 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  47.71 
 
 
344 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  47.71 
 
 
344 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  44.36 
 
 
260 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  39.57 
 
 
217 aa  94  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  47.71 
 
 
344 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  33.64 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>