More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4901 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  100 
 
 
1987 aa  3847    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  51.13 
 
 
623 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  35.82 
 
 
1264 aa  369  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  60.71 
 
 
1755 aa  316  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  38.3 
 
 
570 aa  310  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  36.25 
 
 
637 aa  287  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  47.3 
 
 
440 aa  253  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  45.51 
 
 
374 aa  230  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  36.18 
 
 
1793 aa  203  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  30.88 
 
 
671 aa  198  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  30.21 
 
 
543 aa  198  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  34.3 
 
 
490 aa  196  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.49 
 
 
478 aa  191  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  47.52 
 
 
386 aa  183  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  47.87 
 
 
386 aa  183  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 
544 aa  179  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.16 
 
 
412 aa  179  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.62 
 
 
542 aa  178  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  37.1 
 
 
727 aa  176  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
487 aa  175  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  38.65 
 
 
456 aa  165  8.000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
458 aa  164  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  32.89 
 
 
1394 aa  163  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  39.5 
 
 
320 aa  155  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  45.79 
 
 
540 aa  155  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  45.9 
 
 
510 aa  152  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40 
 
 
319 aa  150  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.23 
 
 
447 aa  149  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  45.05 
 
 
402 aa  147  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  42.34 
 
 
722 aa  146  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  39.84 
 
 
420 aa  145  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  40.44 
 
 
722 aa  144  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  43.66 
 
 
498 aa  142  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  43.09 
 
 
506 aa  141  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  47.17 
 
 
792 aa  141  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.65 
 
 
429 aa  140  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.86 
 
 
427 aa  127  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.2 
 
 
294 aa  127  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 
417 aa  123  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  31.41 
 
 
2074 aa  118  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  36.24 
 
 
428 aa  115  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  47.9 
 
 
193 aa  113  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  40.76 
 
 
401 aa  112  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  43.82 
 
 
380 aa  111  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  39.13 
 
 
381 aa  106  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  32.67 
 
 
322 aa  103  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  32.81 
 
 
314 aa  101  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 
360 aa  99  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
440 aa  95.9  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  39.33 
 
 
345 aa  95.1  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  46.3 
 
 
217 aa  94.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 
239 aa  94  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.3 
 
 
217 aa  94.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  45.69 
 
 
209 aa  93.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 
1026 aa  92.8  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  37.89 
 
 
394 aa  92  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  44.83 
 
 
209 aa  91.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 
417 aa  91.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 
445 aa  91.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  44.83 
 
 
209 aa  91.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  41.45 
 
 
344 aa  90.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  41.45 
 
 
344 aa  90.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  41.45 
 
 
344 aa  90.1  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  35.59 
 
 
449 aa  89.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  40.27 
 
 
388 aa  89.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  41.45 
 
 
345 aa  89.4  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  33.99 
 
 
367 aa  89  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 
169 aa  89  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  37.89 
 
 
392 aa  89  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  37.97 
 
 
375 aa  88.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.28 
 
 
344 aa  88.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2434  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 
507 aa  88.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  42.11 
 
 
351 aa  88.6  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
217 aa  88.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  36.71 
 
 
403 aa  88.2  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  37.97 
 
 
375 aa  88.6  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  42.28 
 
 
344 aa  87.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40.13 
 
 
344 aa  87.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  38.02 
 
 
239 aa  87.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 
189 aa  87.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  34.44 
 
 
365 aa  87  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  45.95 
 
 
729 aa  87.4  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  44.86 
 
 
344 aa  87  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 
369 aa  87  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  43.64 
 
 
658 aa  86.7  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  40 
 
 
670 aa  86.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 
630 aa  86.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 
264 aa  86.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 
263 aa  86.3  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 
216 aa  85.9  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 
239 aa  85.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
525 aa  85.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40 
 
 
350 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 
175 aa  85.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  44.76 
 
 
352 aa  85.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40 
 
 
350 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  40.74 
 
 
510 aa  85.5  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 
658 aa  84.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  36 
 
 
734 aa  84.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  34.46 
 
 
372 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>