70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4651 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  100 
 
 		 671 aa  1305    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1987 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 		 637 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  33.23 
 
 		 623 aa  203  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  45.69 
 
 		 490 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  41.31 
 
 		 722 aa  157  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  44.12 
 
 		 792 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  43.7 
 
 		 722 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.87 
 
 		 374 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  30.03 
 
 		 570 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.35 
 
 		 440 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  26.77 
 
 		 1755 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 458 aa  124  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  34.79 
 
 		 498 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.94 
 
 		 478 aa  112  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  34.96 
 
 		 487 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  31.92 
 
 		 727 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 386 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 543 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  32.84 
 
 		 544 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  32.04 
 
 		 456 aa  94.4  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.62 
 
 		 542 aa  94  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  27.12 
 
 		 540 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35 
 
 		 319 aa  88.6  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013440  Hoch_3905  Thrombospondin type 3 repeat protein  42.68 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6462  OmpA/MotB domain protein  38.96 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  35.87 
 
 		 1264 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  30.43 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  32.9 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.19 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  31.55 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.48 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  35 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  29.85 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  32.83 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  31.42 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  45.92 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  32.67 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  31.01 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0876  peptidase domain protein  37.7 
 
 		 843 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  29.78 
 
 		 1707 aa  57.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2434  OmpA/MotB domain protein  26.42 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  32.81 
 
 		 6109 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  31.9 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 		 401 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  33.87 
 
 		 1335 aa  55.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 486 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 322 aa  51.2  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  31.82 
 
 		 344 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 380 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  31.82 
 
 		 344 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  31.82 
 
 		 344 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  43.08 
 
 		 1918 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  31.06 
 
 		 345 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  26.42 
 
 		 4357 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  36.96 
 
 		 3662 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 314 aa  47.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  32.35 
 
 		 852 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  35.2 
 
 		 823 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  30.3 
 
 		 344 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  27.91 
 
 		 350 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 366 aa  45.8  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  27.91 
 
 		 350 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  43.68 
 
 		 290 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2046  tryptophan synthase, beta chain  32.72 
 
 		 1369 aa  44.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  29.55 
 
 		 344 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  29.2 
 
 		 375 aa  44.3  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  29.2 
 
 		 375 aa  44.3  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  27.69 
 
 		 345 aa  44.3  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>