More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5779 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 570 aa  1119    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  38.36 
 
 		 1987 aa  347  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.57 
 
 		 623 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 1755 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  28.25 
 
 		 637 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  28.52 
 
 		 543 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  28.96 
 
 		 544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  30.22 
 
 		 671 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 440 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.85 
 
 		 542 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 1264 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  30.63 
 
 		 1793 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 727 aa  150  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  33.71 
 
 		 478 aa  137  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.93 
 
 		 456 aa  137  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  29.96 
 
 		 498 aa  133  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  40.87 
 
 		 490 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  34.2 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  34.86 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  36.43 
 
 		 320 aa  123  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.43 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  34.25 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  36.48 
 
 		 458 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  29.5 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.95 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36 
 
 		 447 aa  106  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.44 
 
 		 294 aa  104  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.38 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  25.83 
 
 		 540 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  36.74 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  37.95 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.17 
 
 		 429 aa  88.6  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.29 
 
 		 427 aa  87.8  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  30.74 
 
 		 322 aa  82.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.98 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3905  Thrombospondin type 3 repeat protein  45.14 
 
 		 259 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  33.49 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6462  OmpA/MotB domain protein  33.92 
 
 		 342 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  40.22 
 
 		 1026 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  31.71 
 
 		 401 aa  72  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  41.91 
 
 		 792 aa  70.5  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  31.35 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  31.76 
 
 		 367 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  35.29 
 
 		 722 aa  65.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  29.8 
 
 		 333 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  37.14 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  36.94 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  29.21 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  28.22 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  35.64 
 
 		 1313 aa  61.6  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  41.43 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  28.85 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  40.45 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  34.13 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  30.13 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  29.75 
 
 		 670 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3039  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 		 735 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  35.2 
 
 		 193 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 813 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  32.47 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1876  OmpA/MotB domain-containing protein  31.61 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  32.43 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  29.21 
 
 		 666 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  28.93 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.81 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2449  OmpA/MotB domain protein  38.54 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.81 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  32.03 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1828  OmpA/MotB domain-containing protein  38.54 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.124445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  31.25 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  32.46 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  37.88 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  27.81 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  30 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  29.22 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  31.52 
 
 		 626 aa  57  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  35.79 
 
 		 658 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  38.18 
 
 		 6109 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  33.71 
 
 		 712 aa  57.4  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 262 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  38.54 
 
 		 276 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  29.76 
 
 		 1707 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  26.32 
 
 		 505 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  30.47 
 
 		 344 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3947  serine/threonine protein kinase  50.77 
 
 		 602 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0694263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  30.47 
 
 		 344 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  30.47 
 
 		 345 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  30.47 
 
 		 344 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  26.99 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  32.63 
 
 		 225 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 		 263 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  43.08 
 
 		 245 aa  55.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  34.04 
 
 		 227 aa  54.7  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.68 
 
 		 217 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.75 
 
 		 170 aa  55.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 645 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>