More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2434 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2434  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
507 aa  1031    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  28.09 
 
 
498 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  25.92 
 
 
540 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  43.08 
 
 
1755 aa  97.1  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  43.24 
 
 
193 aa  93.6  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  42.59 
 
 
1987 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
623 aa  86.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 
525 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  35.48 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  35.48 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.85 
 
 
185 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  35.88 
 
 
537 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  32.61 
 
 
637 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  34.62 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  31.94 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  45.35 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  33.85 
 
 
225 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 
296 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  39.25 
 
 
517 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  38.32 
 
 
510 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  41.07 
 
 
219 aa  79.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  36.21 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  24.18 
 
 
506 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  36.21 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.11 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  30 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 
510 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 
543 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  36.36 
 
 
656 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  37.07 
 
 
223 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  33.33 
 
 
626 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1803  OmpA/MotB domain protein  32.88 
 
 
195 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 
230 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  34.86 
 
 
641 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 
230 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 
230 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  36.97 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  36.11 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.25 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  37.07 
 
 
222 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.37 
 
 
542 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  36.97 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  38.1 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 
1026 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  31.37 
 
 
544 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  40.57 
 
 
1793 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  38.18 
 
 
640 aa  73.9  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 
645 aa  73.6  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  27.5 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  33.93 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  29.33 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  30.9 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.45 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 
218 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  31.69 
 
 
459 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
189 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  31.54 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  36.44 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.88 
 
 
707 aa  70.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
673 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.51 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.11 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  39.25 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  30.16 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  30.71 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  30.53 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 
1264 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  35.09 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  30.56 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  33.63 
 
 
671 aa  70.5  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  34.58 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  32.26 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  33.62 
 
 
185 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
333 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  35.14 
 
 
240 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  33.33 
 
 
217 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 
270 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 
228 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.62 
 
 
226 aa  70.1  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 
459 aa  69.7  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>