More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6933 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 630 aa  1303    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  40.82 
 
 		 631 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  36.92 
 
 		 638 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  37.34 
 
 		 658 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  34.56 
 
 		 631 aa  357  5e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  34.88 
 
 		 656 aa  355  2e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  32.73 
 
 		 620 aa  306  7e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.92 
 
 		 641 aa  303  6.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  33.28 
 
 		 640 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  36.27 
 
 		 694 aa  276  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 		 704 aa  257  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.25 
 
 		 673 aa  246  9e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  33.06 
 
 		 510 aa  243  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  34.39 
 
 		 525 aa  243  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  33.26 
 
 		 669 aa  243  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  34.3 
 
 		 670 aa  242  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  34.61 
 
 		 517 aa  237  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  31.74 
 
 		 673 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 		 537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  29.22 
 
 		 668 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  29.7 
 
 		 712 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  32.16 
 
 		 509 aa  213  9e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  30.05 
 
 		 648 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  27.93 
 
 		 666 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  28.93 
 
 		 671 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  31.64 
 
 		 626 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  28.29 
 
 		 656 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  28.52 
 
 		 648 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  29.93 
 
 		 650 aa  184  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 653 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  26.05 
 
 		 903 aa  181  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  26.14 
 
 		 679 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  28.8 
 
 		 672 aa  177  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  29.42 
 
 		 710 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  30.56 
 
 		 660 aa  174  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  27.73 
 
 		 519 aa  170  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  27.29 
 
 		 643 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  31.76 
 
 		 642 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  26.7 
 
 		 665 aa  154  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  30.31 
 
 		 677 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  30.33 
 
 		 630 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  29.38 
 
 		 645 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  32.16 
 
 		 586 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  27.21 
 
 		 504 aa  141  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  29.36 
 
 		 613 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  31.15 
 
 		 798 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 427 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  25.95 
 
 		 757 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 432 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  28.85 
 
 		 585 aa  120  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  35.78 
 
 		 1313 aa  117  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  31.18 
 
 		 594 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  29.23 
 
 		 813 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  37.28 
 
 		 239 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  46.43 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  41.94 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 388 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  50.49 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  52.94 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 374 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  31.06 
 
 		 734 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  48.11 
 
 		 429 aa  99.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  31.78 
 
 		 422 aa  98.6  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  31.06 
 
 		 712 aa  98.2  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  50 
 
 		 447 aa  98.2  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  45.05 
 
 		 424 aa  98.2  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 623 aa  97.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  42.02 
 
 		 320 aa  97.4  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  39.83 
 
 		 209 aa  96.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  48.11 
 
 		 402 aa  97.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  42.37 
 
 		 214 aa  96.3  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  49.02 
 
 		 333 aa  96.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  48.08 
 
 		 226 aa  96.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 230 aa  96.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 		 209 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 		 209 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  42.37 
 
 		 294 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.76 
 
 		 407 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  40.17 
 
 		 241 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 441 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  40.68 
 
 		 215 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  40.68 
 
 		 215 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  41.53 
 
 		 212 aa  95.5  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  40.68 
 
 		 215 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  40.68 
 
 		 215 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  40.68 
 
 		 215 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.46 
 
 		 240 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  40.68 
 
 		 215 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.14 
 
 		 294 aa  95.5  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  40.68 
 
 		 316 aa  94.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  40.68 
 
 		 261 aa  94.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  46.67 
 
 		 466 aa  94.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  44.35 
 
 		 337 aa  94.4  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 		 364 aa  94.4  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.53 
 
 		 215 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  44.86 
 
 		 236 aa  93.6  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.98 
 
 		 217 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>