More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0125 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  100 
 
 
656 aa  1360    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  37.54 
 
 
668 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  36.06 
 
 
648 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  31.97 
 
 
643 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 
650 aa  258  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  29.99 
 
 
665 aa  256  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  29.12 
 
 
712 aa  248  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  30.66 
 
 
626 aa  247  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  29.31 
 
 
757 aa  246  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  30.34 
 
 
660 aa  245  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  28.9 
 
 
653 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
666 aa  236  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  29.88 
 
 
640 aa  229  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  29.46 
 
 
642 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  29.69 
 
 
903 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  27.89 
 
 
672 aa  218  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.61 
 
 
673 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  28.85 
 
 
631 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  29.17 
 
 
630 aa  213  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  28.38 
 
 
641 aa  211  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  29.58 
 
 
677 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  25.8 
 
 
656 aa  203  7e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  28.4 
 
 
645 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.27 
 
 
671 aa  201  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  27.87 
 
 
620 aa  196  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  28.29 
 
 
630 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  27.5 
 
 
658 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  30.11 
 
 
638 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.8 
 
 
631 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  27.57 
 
 
585 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  25.18 
 
 
679 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  29.01 
 
 
734 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  29.18 
 
 
712 aa  146  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  33.67 
 
 
798 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  25.58 
 
 
648 aa  140  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  28.71 
 
 
537 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  27 
 
 
613 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  26.87 
 
 
694 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  27.91 
 
 
525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  32.52 
 
 
813 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  25.28 
 
 
704 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  26.73 
 
 
510 aa  120  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  24.75 
 
 
673 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  24.51 
 
 
669 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  29.01 
 
 
509 aa  115  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  37.23 
 
 
778 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  26.57 
 
 
586 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  23.4 
 
 
670 aa  110  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  35.03 
 
 
568 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  28.92 
 
 
594 aa  107  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  26.13 
 
 
517 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  26.1 
 
 
519 aa  103  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  27.11 
 
 
710 aa  92  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  37.04 
 
 
424 aa  90.5  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  31.71 
 
 
471 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  30.3 
 
 
239 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36.44 
 
 
543 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  36.29 
 
 
637 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  35.65 
 
 
340 aa  83.2  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 
544 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.59 
 
 
542 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.22 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.22 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  33.53 
 
 
263 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  37.27 
 
 
375 aa  80.1  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 
375 aa  80.1  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 
199 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  32.81 
 
 
440 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.69 
 
 
170 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  31.2 
 
 
224 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  32.48 
 
 
623 aa  79  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.85 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  32.8 
 
 
1793 aa  78.2  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1519  Omp18  40 
 
 
173 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 
173 aa  77.8  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2160  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.83 
 
 
157 aa  77.8  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000805861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  27.91 
 
 
1313 aa  77.8  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  35.65 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0812  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.059882  normal  0.756228 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  34.55 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.83 
 
 
170 aa  77.8  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0876  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0023901  normal  0.278188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0908  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00670429  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  33.64 
 
 
415 aa  77  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  34.91 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  33.64 
 
 
505 aa  77  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00701  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 
173 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000036029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0844  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 
173 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000018572  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.42 
 
 
173 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0663  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 
173 aa  77  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000160388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2914  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 
173 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000121586  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0795  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 
173 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.12965e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  30.3 
 
 
167 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0770  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 
173 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00690  hypothetical protein  39.42 
 
 
173 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000599147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>