63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3625 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 471 aa  972    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  34.76 
 
 		 757 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  30.06 
 
 		 798 aa  216  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  30.74 
 
 		 813 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  29.98 
 
 		 643 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  28.69 
 
 		 650 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  29.5 
 
 		 653 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  27.59 
 
 		 660 aa  164  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 		 666 aa  163  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 		 642 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  29.58 
 
 		 645 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 		 712 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  28.42 
 
 		 665 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  26.68 
 
 		 648 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  27.22 
 
 		 585 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  29.15 
 
 		 613 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  26.68 
 
 		 626 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  27.15 
 
 		 668 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  26.4 
 
 		 734 aa  137  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  27.98 
 
 		 778 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  28.36 
 
 		 677 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  32.39 
 
 		 630 aa  120  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  26.93 
 
 		 672 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  36.68 
 
 		 631 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  36.97 
 
 		 903 aa  106  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  40.58 
 
 		 641 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  24.58 
 
 		 673 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  34.47 
 
 		 658 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  33.65 
 
 		 640 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  34.03 
 
 		 656 aa  94.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  30.48 
 
 		 638 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  32.63 
 
 		 631 aa  90.1  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  31.71 
 
 		 656 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  37.5 
 
 		 519 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  38.19 
 
 		 679 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  36.88 
 
 		 671 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  34.69 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 594 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  32.05 
 
 		 648 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  30.5 
 
 		 620 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  35 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  29.9 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  35.56 
 
 		 293 aa  67  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 586 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 		 704 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2161  WD40 domain protein beta Propeller  41.3 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  32.89 
 
 		 694 aa  60.5  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  41.18 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  33.33 
 
 		 670 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  32.58 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2689  WD40 domain protein beta Propeller  41.03 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  25 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  28.07 
 
 		 510 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  28.37 
 
 		 712 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  34.86 
 
 		 525 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 		 537 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1372  hypothetical protein  30.77 
 
 		 473 aa  53.1  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.163525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  29.77 
 
 		 669 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  42.42 
 
 		 504 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  40.3 
 
 		 316 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4002  hypothetical protein  28.57 
 
 		 285 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  32.14 
 
 		 789 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>