More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1880 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  99.73 
 
 		 375 aa  765    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  100 
 
 		 375 aa  768    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  70.34 
 
 		 365 aa  523  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  69.03 
 
 		 362 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  31.51 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.29 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.29 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  34 
 
 		 415 aa  149  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.78 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  49.66 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  30.65 
 
 		 345 aa  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  32.17 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  50.68 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  52.14 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  42.25 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  32.46 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  33.11 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  33.05 
 
 		 344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  33.05 
 
 		 344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.05 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  28.75 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  33.22 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  47.92 
 
 		 447 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  35.74 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  32.03 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  27.36 
 
 		 401 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  30.64 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  34.08 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  35.93 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.04 
 
 		 427 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.14 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40.36 
 
 		 478 aa  116  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  35.14 
 
 		 394 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  44.83 
 
 		 428 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  33.91 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  38.54 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  37.1 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.11 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  41.29 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  28.33 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  44.36 
 
 		 226 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  34.2 
 
 		 367 aa  109  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.25 
 
 		 440 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  39.74 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  26.75 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  39.26 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.24 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  39.74 
 
 		 490 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  46.72 
 
 		 640 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40.13 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.92 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.75 
 
 		 240 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  44.07 
 
 		 537 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  41.29 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.29 
 
 		 543 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  41.72 
 
 		 544 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  38.41 
 
 		 230 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.72 
 
 		 542 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  39.07 
 
 		 231 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  38.41 
 
 		 230 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  41.29 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  39.24 
 
 		 727 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.41 
 
 		 230 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  42.4 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  44.35 
 
 		 671 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  42.14 
 
 		 498 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  43.52 
 
 		 463 aa  96.3  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  49.53 
 
 		 321 aa  96.3  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 		 224 aa  96.3  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  43.97 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.65 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  45.71 
 
 		 230 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  49.02 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  43.64 
 
 		 694 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  27.83 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  36.25 
 
 		 264 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.96 
 
 		 623 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  27.7 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  27.7 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  46.55 
 
 		 209 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  38.36 
 
 		 456 aa  94.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  42.5 
 
 		 210 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  43.12 
 
 		 620 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  27.7 
 
 		 319 aa  94  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  33.7 
 
 		 510 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  38.12 
 
 		 637 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 		 225 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  44.64 
 
 		 241 aa  93.2  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  35.76 
 
 		 230 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 679 aa  93.2  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 236 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  44.44 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  44.04 
 
 		 286 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  48.04 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  29.5 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  35.88 
 
 		 1987 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  45.28 
 
 		 261 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>