More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1058 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  100 
 
 		 672 aa  1389    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  31.04 
 
 		 668 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  29.88 
 
 		 626 aa  245  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  29.58 
 
 		 640 aa  228  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  27.55 
 
 		 666 aa  224  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  30.13 
 
 		 648 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  28.12 
 
 		 650 aa  222  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  26.93 
 
 		 643 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  29.17 
 
 		 665 aa  220  7e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  27.89 
 
 		 656 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.71 
 
 		 673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  28.81 
 
 		 631 aa  213  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  29.09 
 
 		 653 aa  213  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  30.25 
 
 		 660 aa  212  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  27.83 
 
 		 641 aa  212  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  30.22 
 
 		 671 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  26.32 
 
 		 656 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  28.41 
 
 		 642 aa  201  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  29.96 
 
 		 638 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  25.72 
 
 		 645 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.46 
 
 		 631 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  27.06 
 
 		 630 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  27.62 
 
 		 613 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  25.78 
 
 		 677 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  28.3 
 
 		 679 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  27.18 
 
 		 585 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  28.68 
 
 		 620 aa  179  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  26.78 
 
 		 658 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  27.23 
 
 		 903 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  29.45 
 
 		 630 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  27.81 
 
 		 757 aa  158  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  28.52 
 
 		 669 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  28.3 
 
 		 670 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  31.08 
 
 		 798 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  29.8 
 
 		 712 aa  138  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  26.53 
 
 		 648 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  27.82 
 
 		 694 aa  136  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  23.86 
 
 		 712 aa  136  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  24.6 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  26.49 
 
 		 517 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  26.74 
 
 		 734 aa  120  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  26.81 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  24.81 
 
 		 704 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  26.93 
 
 		 471 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  25.08 
 
 		 710 aa  114  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  27.51 
 
 		 525 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  27.81 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  28.86 
 
 		 813 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  25.94 
 
 		 519 aa  109  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  39.26 
 
 		 568 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  32.09 
 
 		 586 aa  98.2  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  26.42 
 
 		 594 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  24.05 
 
 		 673 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  29.9 
 
 		 778 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  47.06 
 
 		 415 aa  87.8  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  49.43 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.19 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  47.73 
 
 		 346 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  47.73 
 
 		 346 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  47.73 
 
 		 354 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  47.73 
 
 		 346 aa  83.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  47.73 
 
 		 350 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  47.73 
 
 		 346 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.31 
 
 		 192 aa  83.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  47.73 
 
 		 346 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  47.73 
 
 		 365 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  48.28 
 
 		 362 aa  83.2  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  46.59 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  45.45 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  44.19 
 
 		 266 aa  80.1  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  45.45 
 
 		 369 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  44.32 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  47.13 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  32.47 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  44.32 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  44.32 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  47.13 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  44.32 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  45.24 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  28.06 
 
 		 1313 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  41.11 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  40.7 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  43.02 
 
 		 364 aa  76.6  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 623 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  44.32 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.05 
 
 		 188 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38.3 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  31.4 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  34.07 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  43.68 
 
 		 637 aa  74.3  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  43.18 
 
 		 361 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  43.21 
 
 		 330 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  43.02 
 
 		 399 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  41.86 
 
 		 354 aa  73.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.35 
 
 		 181 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  38.27 
 
 		 320 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>