More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2008 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  100 
 
 
509 aa  1055    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  32.46 
 
 
631 aa  249  9e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 
658 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  33 
 
 
620 aa  233  8.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  32.55 
 
 
504 aa  232  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.97 
 
 
656 aa  226  8e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 
638 aa  226  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  34.39 
 
 
694 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  33.27 
 
 
517 aa  224  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  32.99 
 
 
631 aa  223  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  32.16 
 
 
630 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 
640 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  33.12 
 
 
673 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  29.96 
 
 
641 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 
525 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  33.26 
 
 
648 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  30.83 
 
 
670 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  30.53 
 
 
537 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  30.95 
 
 
669 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  29.51 
 
 
510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  30.35 
 
 
704 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.07 
 
 
673 aa  176  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  27.95 
 
 
757 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  29.38 
 
 
626 aa  164  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  30.7 
 
 
668 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.81 
 
 
671 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  26.35 
 
 
660 aa  143  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  26.78 
 
 
679 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  26.11 
 
 
656 aa  136  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  28.51 
 
 
643 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  25.14 
 
 
798 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  24.51 
 
 
712 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  25.09 
 
 
710 aa  128  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  31.07 
 
 
432 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  26.81 
 
 
672 aa  123  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  24.68 
 
 
734 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  30.51 
 
 
677 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  25.67 
 
 
648 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  27.27 
 
 
665 aa  120  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  25 
 
 
903 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  27.72 
 
 
666 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  31.51 
 
 
427 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  25.55 
 
 
630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  44 
 
 
241 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  30.11 
 
 
594 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.81 
 
 
407 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  26.08 
 
 
642 aa  106  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  29.74 
 
 
585 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  28.15 
 
 
613 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  26.03 
 
 
645 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 
412 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  25.99 
 
 
650 aa  104  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  27.05 
 
 
653 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  26 
 
 
519 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  47.12 
 
 
319 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 
364 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.34 
 
 
240 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  47.22 
 
 
231 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
768 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  43.24 
 
 
1793 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  34.83 
 
 
1313 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
586 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  35.42 
 
 
653 aa  94.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.86 
 
 
294 aa  94  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 
362 aa  94.4  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 
264 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 
459 aa  93.6  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 
219 aa  93.2  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 
239 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 
388 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  47.52 
 
 
330 aa  91.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  44.44 
 
 
266 aa  91.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  35.44 
 
 
537 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.67 
 
 
230 aa  91.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  45.19 
 
 
352 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
244 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  39.39 
 
 
365 aa  90.9  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 
218 aa  90.9  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 
218 aa  90.9  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 
220 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 
239 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  46.23 
 
 
219 aa  90.1  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  33.93 
 
 
322 aa  90.1  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  38.33 
 
 
415 aa  89.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 
220 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 
237 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 
220 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  41.51 
 
 
220 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  39.09 
 
 
422 aa  89.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.32 
 
 
506 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  43 
 
 
367 aa  89.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.93 
 
 
321 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 
242 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  38 
 
 
286 aa  88.2  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  35.56 
 
 
464 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  44.9 
 
 
335 aa  87.8  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 
498 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  29.51 
 
 
623 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  45.19 
 
 
214 aa  87.4  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  40 
 
 
481 aa  87  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>