More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4274 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
568 aa  1169    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  47.55 
 
 
668 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  40.41 
 
 
648 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  29.85 
 
 
757 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 
671 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  33.49 
 
 
734 aa  117  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  35.03 
 
 
656 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  31.22 
 
 
679 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  39.26 
 
 
672 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  33.54 
 
 
798 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  30.73 
 
 
665 aa  97.1  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 
813 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  30.34 
 
 
643 aa  94  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 
650 aa  93.6  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  51.9 
 
 
585 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  48.1 
 
 
660 aa  93.2  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  51.9 
 
 
613 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  27.78 
 
 
641 aa  91.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  28.86 
 
 
677 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  29.12 
 
 
640 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  36.25 
 
 
626 aa  87  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  42.35 
 
 
903 aa  84.3  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  48.72 
 
 
362 aa  84  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  43 
 
 
673 aa  84  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  40.7 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  44.19 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  31.95 
 
 
509 aa  80.1  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  32.62 
 
 
630 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  30.94 
 
 
642 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  44.87 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  37.63 
 
 
537 aa  77  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  28 
 
 
630 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  26.03 
 
 
399 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.68 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  42.5 
 
 
594 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.08 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  41.11 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  31.58 
 
 
710 aa  73.9  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 
645 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  27.04 
 
 
505 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  38.27 
 
 
266 aa  72.8  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  39.74 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  42.31 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.74 
 
 
478 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  28.66 
 
 
620 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.24 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38.27 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  31.54 
 
 
669 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  43.59 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02683  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.73 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000140818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  27.14 
 
 
623 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.27 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  33.59 
 
 
694 aa  68.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  34.74 
 
 
586 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  35 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.73 
 
 
525 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2347  OmpA/MotB  40.51 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  32.18 
 
 
510 aa  67.8  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 
537 aa  67.4  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  37.93 
 
 
517 aa  67.8  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  32.28 
 
 
670 aa  67.8  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 
637 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  40.79 
 
 
209 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  36.14 
 
 
193 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.25 
 
 
190 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  40.24 
 
 
355 aa  66.6  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  29.27 
 
 
656 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  36.05 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.66 
 
 
240 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  39.24 
 
 
364 aa  65.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
296 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.37 
 
 
374 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 
361 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 
373 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00701  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
173 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000036029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.73 
 
 
173 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00690  hypothetical protein  39.73 
 
 
173 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000599147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
168 aa  65.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0663  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
173 aa  65.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000160388  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0844  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
173 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000018572  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2914  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
173 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000121586  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0764  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
173 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105937  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0770  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
173 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0795  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
173 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.12965e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
168 aa  65.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 
209 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  37.04 
 
 
231 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.8 
 
 
217 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
490 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0812  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
174 aa  64.3  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.059882  normal  0.756228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0876  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
174 aa  64.3  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0023901  normal  0.278188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
174 aa  64.3  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
173 aa  64.3  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0908  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
174 aa  64.3  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00670429  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.73 
 
 
174 aa  64.3  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  35.14 
 
 
320 aa  64.3  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  42.65 
 
 
373 aa  63.9  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.36 
 
 
294 aa  63.9  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>